Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN2Q6IMN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN2Q6IMN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPRIN2Q6IMN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN2Q6IMN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms