Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP5B1Q2VPB7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP5B1Q2VPB7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms