Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 BUD20YLR074C 501 nt7.61□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 ERV2YPR037C 591 nt7.61□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 GET2YER083C 858 nt7.6□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 YLR030WYLR030W 792 nt7.6□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 ITR1YDR497C 1755 nt7.59□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 DCR2YLR361C 1737 nt7.59□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 YOR343CYOR343C 327 nt7.59□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 YPT10YBR264C 600 nt7.59□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 HNM1YGL077C 1692 nt7.59□□□□□ -1.19
AVL9Q12500 KAE1YKR038C 1161 nt7.58□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 OSM1YJR051W 1506 nt7.57□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 GGC1YDL198C 903 nt7.57□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 STS1YIR011C 960 nt7.57□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 SPE4YLR146C 903 nt7.57□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 FRT1YOR324C 1809 nt7.57□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 PRC1YMR297W 1599 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 CHA1YCL064C 1083 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 TPI1YDR050C 747 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 YDR476CYDR476C 675 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 YJR142WYJR142W 1029 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 ATP10YLR393W 840 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 YOR041CYOR041C 432 nt7.56□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 GNA1YFL017C 480 nt7.55□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 OPI1YHL020C 1215 nt7.55□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 YAH1YPL252C 519 nt7.55□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 TOP3YLR234W 1971 nt7.55□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 PET494YNR045W 1470 nt7.55□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 SKP1YDR328C 585 nt7.54□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 SNF7YLR025W 723 nt7.54□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 MAL31YBR298C 1845 nt7.54□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 BDS1YOL164W 1941 nt7.54□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 FUS3YBL016W 1062 nt7.53□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 DSC3YOR223W 879 nt7.53□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 CKI1YLR133W 1749 nt7.52□□□□□ -1.2
AVL9Q12500 RTC2YBR147W 891 nt7.52□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 CRN1YLR429W 1956 nt7.51□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 BEM1YBR200W 1656 nt7.51□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.51□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 TCB1YOR086C 3561 nt7.51□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 YDR327WYDR327W 327 nt7.5□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 NMA2YGR010W 1188 nt7.5□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 PRY2YKR013W 990 nt7.5□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 UBP13YBL067C 2244 nt7.5□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 CCR4YAL021C 2514 nt7.48□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 HRB1YNL004W 1365 nt7.48□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 PMA2YPL036W 2844 nt7.48□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 YLR358CYLR358C 564 nt7.48□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 CTF3YLR381W 2202 nt7.48□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 ERG24YNL280C 1317 nt7.47□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 AFG3YER017C 2286 nt7.47□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 BAP3YDR046C 1815 nt7.46□□□□□ -1.21
AVL9Q12500 YGL081WYGL081W 963 nt7.46□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 MLS1YNL117W 1665 nt7.46□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 CDC23YHR166C 1881 nt7.46□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 ERR3YMR323W 1314 nt7.46□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 ERR1YOR393W 1314 nt7.46□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 ERR2YPL281C 1314 nt7.46□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 GTS1YGL181W 1191 nt7.45□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 DOC1YGL240W 753 nt7.45□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 CDC3YLR314C 1563 nt7.45□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 RMD8YFR048W 1989 nt7.44□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 MSI1YBR195C 1269 nt7.43□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 NDE1YMR145C 1683 nt7.43□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 MSS51YLR203C 1311 nt7.43□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 SMC5YOL034W 3282 nt7.43□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 CBK1YNL161W 2271 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 YGL260WYGL260W 231 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 YKL147CYKL147C 618 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 CCW12YLR110C 402 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 YMR253CYMR253C 1245 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 LIP5YOR196C 1245 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 YPL041CYPL041C 624 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 YKR018CYKR018C 2178 nt7.42□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 MAS2YHR024C 1449 nt7.41□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 RPL12BYDR418W 498 nt7.4□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 PIL1YGR086C 1020 nt7.4□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 RDR1YOR380W 1641 nt7.4□□□□□ -1.22
AVL9Q12500 MGM101YJR144W 810 nt7.39□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 FLC2YAL053W 2352 nt7.39□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 CAN1YEL063C 1773 nt7.38□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 ADH6YMR318C 1083 nt7.38□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 PRB1YEL060C 1908 nt7.38□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 CDC7YDL017W 1524 nt7.37□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 YER137CYER137C 447 nt7.37□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 AQR1YNL065W 1761 nt7.37□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 EXG2YDR261C 1689 nt7.37□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 YJL213WYJL213W 996 nt7.35□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 PAM17YKR065C 594 nt7.35□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 SEC24YIL109C 2781 nt7.34□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 PET117YER058W 324 nt7.34□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 YML122CYML122C 381 nt7.34□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 YMR074CYMR074C 438 nt7.34□□□□□ -1.23
AVL9Q12500 FCY2YER056C 1602 nt7.34□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 NUP57YGR119C 1626 nt7.34□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 YIL108WYIL108W 2091 nt7.33□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 ATO2YNR002C 849 nt7.33□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 ATP23YNR020C 813 nt7.33□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 YNL040WYNL040W 1371 nt7.33□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 PGI1YBR196C 1665 nt7.32□□□□□ -1.24
AVL9Q12500 POB3YML069W 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.6 ms