Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YJR115WYJR115W 510 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 SLD7YOR060C 774 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YBR292CYBR292C 372 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 DIT1YDR403W 1611 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 snR57snR57 88 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 MAK32YCR019W 1092 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 ENT5YDR153C 1236 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 SLM4YBR077C 489 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 HEM14YER014W 1620 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 RMD5YDR255C 1266 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 KRE28YDR532C 1158 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YGR066CYGR066C 879 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YGR168CYGR168C 1131 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YHR140WYHR140W 720 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 IRC14YOR135C 342 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 HEM15YOR176W 1182 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 HIS3YOR202W 663 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 DML1YMR211W 1428 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 DAL2YIR029W 1032 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YJL009WYJL009W 327 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 YOL024WYOL024W 519 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 ATG23YLR431C 1362 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-NL1Q12391 HAS1YMR290C 1518 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YEL008WYEL008W 381 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 PCL6YER059W 1263 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YER138W-AYER138W-A 105 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 CTK2YJL006C 972 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YKR075CYKR075C 924 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 CTR3YLR411W 726 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YPT11YNL304W 1254 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 RAM1YDL090C 1296 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YEA4YEL004W 1029 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 SPG5YMR191W 1122 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 BAG7YOR134W 1230 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 CBK1YNL161W 2271 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YBR056WYBR056W 1506 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 PAR32YDL173W 888 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YDR161WYDR161W 1164 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 OKP1YGR179C 1221 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YAP7YOL028C 738 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 SPE2YOL052C 1191 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 LYS20YDL182W 1287 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 GCV1YDR019C 1203 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 NIF3YGL221C 867 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 FUN14YAL008W 597 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 VPS20YMR077C 666 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YIF1YNL263C 945 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 PGC1YPL206C 966 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 ECM2YBR065C 1095 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 PFS2YNL317W 1398 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 KAR1YNL188W 1302 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 YDL129WYDL129W 876 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 HDA1YNL021W 2121 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 HSV2YGR223C 1347 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 CDC10YCR002C 969 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 TCA17YEL048C 459 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 SUT1YGL162W 900 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 ATP12YJL180C 978 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 SAW1YAL027W 786 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 APS2YJR058C 444 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 RPF2YKR081C 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 MDH2YOL126C 1134 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 MEP1YGR121C 1479 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-NL1Q12391 NMT1YLR195C 1368 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 WHI4YDL224C 1950 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 RTN1YDR233C 888 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YJR149WYJR149W 1215 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 SEN2YLR105C 1134 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 GSF2YML048W 1212 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 GTR1YML121W 933 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 FSH2YMR222C 672 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 KRE1YNL322C 942 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 ATG29YPL166W 642 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 TUB4YLR212C 1422 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YKR015CYKR015C 1707 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 IPI3YNL182C 1668 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 OCA4YCR095C 1089 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 RPC53YDL150W 1269 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YDL241WYDL241W 372 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 SEC28YIL076W 891 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 BUB2YMR055C 921 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 RRP15YPR143W 753 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 HER2YMR293C 1395 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 NDE2YDL085W 1638 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 NAS2YIL007C 663 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YIR035CYIR035C 765 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 SNF7YLR025W 723 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 VTA1YLR181C 993 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 AVO2YMR068W 1281 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 FRA1YLL029W 2250 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 ARO9YHR137W 1542 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 GPI18YBR004C 1302 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 MUM3YOR298W 1440 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 UBC5YDR059C 447 nt7.3□□□□□ -1.24
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