Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt10.95□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 DAL80YKR034W 810 nt10.95□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 YLR463CYLR463C 552 nt10.95□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 YMR252CYMR252C 405 nt10.94□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 YOL046CYOL046C 675 nt10.94□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 GET4YOR164C 939 nt10.94□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 HTZ1YOL012C 405 nt10.93□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 LEA1YPL213W 717 nt10.93□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 MPE1YKL059C 1326 nt10.92□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 YHR033WYHR033W 1272 nt10.92□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 OSW2YLR054C 2175 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 YJL213WYJL213W 996 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 PAM17YKR065C 594 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 TUB1YML085C 1344 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 DMC1YER179W 1005 nt10.9□□□□□ -0.66
TY1B-NL1Q12112 FYV1YDR024W 486 nt10.9□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 IRC7YFR055W 1023 nt10.89□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 FMP40YPL222W 2067 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 YKL147CYKL147C 618 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 YPR076WYPR076W 375 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 YDR215CYDR215C 414 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 MED6YHR058C 888 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 COX15YER141W 1461 nt10.86□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 CDA1YLR307W 906 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 ADE5,7YGL234W 2409 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1B-NL1Q12112 RTC4YNL254C 1206 nt10.83□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 FIT2YOR382W 462 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 ASR1YPR093C 867 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 YDL144CYDL144C 1071 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 PSD1YNL169C 1503 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 COQ3YOL096C 939 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 ADH5YBR145W 1056 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 CIT2YCR005C 1383 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 PPH21YDL134C 1110 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 ASF1YJL115W 840 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 PLB2YMR006C 2121 nt10.79□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 RBS1YDL189W 1374 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 KTR4YBR199W 1395 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 APE4YHR113W 1473 nt10.77□□□□□ -0.68
TY1B-NL1Q12112 YNL140CYNL140C 570 nt10.77□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 YKL102CYKL102C 306 nt10.76□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 MRPS18YNL306W 654 nt10.76□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 RIM8YGL045W 1629 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 YPL102CYPL102C 303 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 PRE3YJL001W 648 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 YML018CYML018C 1182 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 FTH1YBR207W 1398 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 YIP4YGL198W 708 nt10.73□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt10.73□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 RCF2YNR018W 675 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 LEO1YOR123C 1395 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 CDC1YDR182W 1476 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1B-NL1Q12112 YKR045CYKR045C 552 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 PET10YKR046C 852 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 NTG2YOL043C 1143 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 TOP3YLR234W 1971 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 SAL1YNL083W 1485 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 GPD2YOL059W 1323 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 YCR049CYCR049C 447 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 FPR3YML074C 1236 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 TAF9YMR236W 474 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 YNL092WYNL092W 1203 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 TFG2YGR005C 1203 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 CAR2YLR438W 1275 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 YDR187CYDR187C 519 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 HSL7YBR133C 2484 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 YPQ2YDR352W 954 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1B-NL1Q12112 SUF3tG(CCC)D 72 nt10.65□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 YMR295CYMR295C 594 nt10.65□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 RRP9YPR137W 1722 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 YGL114WYGL114W 2178 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 URA8YJR103W 1737 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 PET117YER058W 324 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 YBR113WYBR113W 483 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 ADE16YLR028C 1776 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 BRN1YBL097W 2265 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 YAH1YPL252C 519 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 CYT1YOR065W 930 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 YLL058WYLL058W 1728 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 GCG1YER163C 699 nt10.6□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 PEX28YHR150W 1740 nt10.59□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 AVL9YLR114C 2295 nt10.59□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 TSR2YLR435W 618 nt10.59□□□□□ -0.71
TY1B-NL1Q12112 TPO4YOR273C 1980 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 NUP49YGL172W 1419 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 CKB1YGL019W 837 nt10.57□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 YNR005CYNR005C 405 nt10.57□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 MSC3YLR219W 2187 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 RDR1YOR380W 1641 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 YMR122CYMR122C 375 nt10.55□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 YHL008CYHL008C 1884 nt10.55□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 RNH201YNL072W 924 nt10.54□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 RPS28AYOR167C 204 nt10.52□□□□□ -0.72
TY1B-NL1Q12112 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-NL1Q12112 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-NL1Q12112 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-NL1Q12112 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-NL1Q12112 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-NL1Q12112 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt10.52□□□□□ -0.73
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