Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 GTS1YGL181W 1191 nt8.49□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 OPI1YHL020C 1215 nt8.49□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 POB3YML069W 1659 nt8.49□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 SPR1YOR190W 1338 nt8.49□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 BDS1YOL164W 1941 nt8.48□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 PNS1YOR161C 1620 nt8.48□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 HAC1YFL031W 717 nt8.48□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 PRY2YKR013W 990 nt8.48□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 RTC2YBR147W 891 nt8.48□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 MSS51YLR203C 1311 nt8.48□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 BUR6YER159C 429 nt8.47□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 YGL260WYGL260W 231 nt8.47□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 FHN1YGR131W 525 nt8.47□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 PSP2YML017W 1782 nt8.47□□□□□ -1.05
HRQ1Q05549 PSA1YDL055C 1086 nt8.46□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 GET2YER083C 858 nt8.46□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 NCA3YJL116C 1014 nt8.46□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 ALR1YOL130W 2580 nt8.46□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 AQR1YNL065W 1761 nt8.45□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 AFG3YER017C 2286 nt8.45□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 TOD6YBL054W 1578 nt8.45□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 BNS1YGR230W 414 nt8.45□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 REC114YMR133W 1287 nt8.45□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 BAP3YDR046C 1815 nt8.45□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 GAL2YLR081W 1725 nt8.44□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 YKL147CYKL147C 618 nt8.44□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 LIP5YOR196C 1245 nt8.44□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 BNA3YJL060W 1335 nt8.44□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 YDR327WYDR327W 327 nt8.43□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 TAD2YJL035C 753 nt8.43□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 MCM5YLR274W 2328 nt8.43□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 CAN1YEL063C 1773 nt8.43□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 PUS7YOR243C 2031 nt8.42□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 ERV2YPR037C 591 nt8.42□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 HEM14YER014W 1620 nt8.42□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 EXG2YDR261C 1689 nt8.42□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 ENB1YOL158C 1821 nt8.42□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 YDR306CYDR306C 1437 nt8.41□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 GDH1YOR375C 1365 nt8.41□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 CPT1YNL130C 1182 nt8.41□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 YPT10YBR264C 600 nt8.41□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 FCY2YER056C 1602 nt8.4□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 HMT1YBR034C 1047 nt8.4□□□□□ -1.06
HRQ1Q05549 GGC1YDL198C 903 nt8.39□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 GRH1YDR517W 1119 nt8.39□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 ADE1YAR015W 921 nt8.39□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 NUP53YMR153W 1428 nt8.38□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 SKP1YDR328C 585 nt8.38□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 NUP57YGR119C 1626 nt8.37□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 RDR1YOR380W 1641 nt8.37□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 ERG24YNL280C 1317 nt8.37□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 YIA6YIL006W 1122 nt8.37□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 FRT1YOR324C 1809 nt8.37□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 PMA2YPL036W 2844 nt8.36□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 SRN2YLR119W 642 nt8.36□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 ATO2YNR002C 849 nt8.36□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 DSC3YOR223W 879 nt8.36□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 OSM1YJR051W 1506 nt8.35□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 ATG17YLR423C 1254 nt8.35□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 MRP1YDR347W 966 nt8.34□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 YJR142WYJR142W 1029 nt8.34□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 LOT6YLR011W 576 nt8.34□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.34□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 TOS1YBR162C 1368 nt8.34□□□□□ -1.07
HRQ1Q05549 STS1YIR011C 960 nt8.33□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt8.33□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 KDX1YKL161C 1302 nt8.32□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 CRN1YLR429W 1956 nt8.32□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 RIB1YBL033C 1038 nt8.32□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 RFS1YBR052C 633 nt8.32□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 CDC7YDL017W 1524 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 SNF4YGL115W 969 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 SOD2YHR008C 702 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 HRA1HRA1 564 nt8.31□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 CTF3YLR381W 2202 nt8.29□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 NMA2YGR010W 1188 nt8.29□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 PGI1YBR196C 1665 nt8.29□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 HRB1YNL004W 1365 nt8.28□□□□□ -1.08
HRQ1Q05549 CCW12YLR110C 402 nt8.27□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 YMR074CYMR074C 438 nt8.27□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 YOR012WYOR012W 414 nt8.27□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 YDR476CYDR476C 675 nt8.26□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 RMA1YKL132C 1293 nt8.26□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 NUP84YDL116W 2181 nt8.25□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 CDC3YLR314C 1563 nt8.24□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 MAS2YHR024C 1449 nt8.24□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 ERG27YLR100W 1044 nt8.24□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 YCR041WYCR041W 333 nt8.23□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 BMT5YIL096C 1011 nt8.22□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 YPL071CYPL071C 471 nt8.22□□□□□ -1.09
HRQ1Q05549 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.21□□□□□ -1.1
HRQ1Q05549 DMC1YER179W 1005 nt8.2□□□□□ -1.1
HRQ1Q05549 DOC1YGL240W 753 nt8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.9 ms