Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 ADE2YOR128C 1716 nt6.02□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 RMD8YFR048W 1989 nt6.02□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 GCD11YER025W 1584 nt6.02□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 TOD6YBL054W 1578 nt6.02□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 POB3YML069W 1659 nt6.02□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 RTC2YBR147W 891 nt6.02□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 YER137CYER137C 447 nt6.01□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 ADE1YAR015W 921 nt6.01□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 SNU66YOR308C 1764 nt6.01□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 NUP53YMR153W 1428 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 ENB1YOL158C 1821 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 FRT1YOR324C 1809 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 RRP43YCR035C 1185 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 GGC1YDL198C 903 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 OPI1YHL020C 1215 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 YAH1YPL252C 519 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 TOS1YBR162C 1368 nt6□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 BAP3YDR046C 1815 nt5.99□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 BDS1YOL164W 1941 nt5.99□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 INP54YOL065C 1155 nt5.99□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 YKL147CYKL147C 618 nt5.98□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 AFG3YER017C 2286 nt5.98□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 CAN1YEL063C 1773 nt5.98□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.97□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 BNA3YJL060W 1335 nt5.97□□□□□ -1.45
YHP1Q04116 YDR476CYDR476C 675 nt5.96□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 FUS3YBL016W 1062 nt5.96□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 YDR306CYDR306C 1437 nt5.96□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 PSP2YML017W 1782 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 GET2YER083C 858 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 KAE1YKR038C 1161 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 LIP5YOR196C 1245 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 FCY2YER056C 1602 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 SPS1YDR523C 1473 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 PET494YNR045W 1470 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 SPR1YOR190W 1338 nt5.95□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 PPZ2YDR436W 2133 nt5.94□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 EDC2YER035W 438 nt5.94□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 PRY2YKR013W 990 nt5.94□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 ATO2YNR002C 849 nt5.94□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 NUP84YDL116W 2181 nt5.94□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 MAM3YOL060C 2121 nt5.93□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 AFG2YLR397C 2343 nt5.93□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 YDR327WYDR327W 327 nt5.93□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 CPT1YNL130C 1182 nt5.93□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 YOR268CYOR268C 399 nt5.93□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 PNS1YOR161C 1620 nt5.92□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 HAC1YFL031W 717 nt5.92□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 LOT6YLR011W 576 nt5.92□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 ERG24YNL280C 1317 nt5.92□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 NUP57YGR119C 1626 nt5.92□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 ECM10YEL030W 1935 nt5.91□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt5.91□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 ADE5,7YGL234W 2409 nt5.9□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 PSA1YDL055C 1086 nt5.9□□□□□ -1.46
YHP1Q04116 EXG2YDR261C 1689 nt5.9□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 CTF3YLR381W 2202 nt5.89□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 ERV2YPR037C 591 nt5.89□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 YPT10YBR264C 600 nt5.89□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 DSC3YOR223W 879 nt5.88□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 RDR1YOR380W 1641 nt5.88□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 RFS1YBR052C 633 nt5.87□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 CRN1YLR429W 1956 nt5.87□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 MAS2YHR024C 1449 nt5.86□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 YOR012WYOR012W 414 nt5.86□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 MHP1YJL042W 4197 nt5.85□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 YLR112WYLR112W 420 nt5.85□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 YLR358CYLR358C 564 nt5.85□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 YCR041WYCR041W 333 nt5.84□□□□□ -1.47
YHP1Q04116 PGI1YBR196C 1665 nt5.83□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 SKP1YDR328C 585 nt5.83□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 STS1YIR011C 960 nt5.83□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 YJR142WYJR142W 1029 nt5.83□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 YMR074CYMR074C 438 nt5.83□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 CDC7YDL017W 1524 nt5.83□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 SNF4YGL115W 969 nt5.82□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 PRE5YMR314W 705 nt5.82□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 MFG1YDL233W 1377 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 HRB1YNL004W 1365 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 CDC3YLR314C 1563 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 OSM1YJR051W 1506 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 PAC10YGR078C 600 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 CCW12YLR110C 402 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 PHO85YPL031C 918 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 YIL108WYIL108W 2091 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 YBL111CYBL111C 2004 nt5.81□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 PPS1YBR276C 2424 nt5.8□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 NCA3YJL116C 1014 nt5.8□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 YJL213WYJL213W 996 nt5.8□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 SUN4YNL066W 1263 nt5.8□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 HHY1YEL059W 309 nt5.79□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 NMA2YGR010W 1188 nt5.79□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 PIL1YGR086C 1020 nt5.79□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 ERG27YLR100W 1044 nt5.79□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 YEL023CYEL023C 2049 nt5.79□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 AIM2YAL049C 741 nt5.78□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 SDH8YBR269C 417 nt5.78□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 EFM1YHL039W 1758 nt5.78□□□□□ -1.48
YHP1Q04116 SEC23YPR181C 2307 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms