Protein–RNA interactions for Protein: P53297

PBP1, PAB1-binding protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PBP1P53297 AVO2YMR068W 1281 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 CTR1YPR124W 1221 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 CIR2YOR356W 1896 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 ITR1YDR497C 1755 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 TFC6YDR362C 2019 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 GAT1YFL021W 1533 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 CHA1YCL064C 1083 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 RRP1YDR087C 837 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 YLR036CYLR036C 612 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 ALG7YBR243C 1347 nt7.24□□□□□ -1.25
PBP1P53297 HSV2YGR223C 1347 nt7.23□□□□□ -1.25
PBP1P53297 CRN1YLR429W 1956 nt7.22□□□□□ -1.25
PBP1P53297 YDR467CYDR467C 327 nt7.22□□□□□ -1.25
PBP1P53297 CAK1YFL029C 1107 nt7.22□□□□□ -1.25
PBP1P53297 RRT14YIL127C 621 nt7.22□□□□□ -1.25
PBP1P53297 MFT1YML062C 1179 nt7.22□□□□□ -1.25
PBP1P53297 GDH1YOR375C 1365 nt7.21□□□□□ -1.25
PBP1P53297 LYS12YIL094C 1116 nt7.21□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.21□□□□□ -1.26
PBP1P53297 DSE3YOR264W 1293 nt7.21□□□□□ -1.26
PBP1P53297 OPT1YJL212C 2400 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 HXT13YEL069C 1695 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 NPP2YEL016C 1482 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 CHS7YHR142W 951 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 ADA2YDR448W 1305 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 NEM1YHR004C 1341 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YNL040WYNL040W 1371 nt7.2□□□□□ -1.26
PBP1P53297 AFG2YLR397C 2343 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 OCH1YGL038C 1443 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 GGA2YHR108W 1758 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YER156CYER156C 1017 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 GPM1YKL152C 744 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YMR114CYMR114C 1107 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YOR268CYOR268C 399 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 CMR1YDL156W 1569 nt7.19□□□□□ -1.26
PBP1P53297 RGT2YDL138W 2292 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 SLM3YDL033C 1254 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 UTR5YEL035C 501 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YLR311CYLR311C 348 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 MSB3YNL293W 1902 nt7.18□□□□□ -1.26
PBP1P53297 PRC1YMR297W 1599 nt7.17□□□□□ -1.26
PBP1P53297 EDC2YER035W 438 nt7.17□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YBL095WYBL095W 813 nt7.17□□□□□ -1.26
PBP1P53297 STD1YOR047C 1335 nt7.17□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YFL052WYFL052W 1398 nt7.17□□□□□ -1.26
PBP1P53297 TAD2YJL035C 753 nt7.16□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.16□□□□□ -1.26
PBP1P53297 ATO2YNR002C 849 nt7.16□□□□□ -1.26
PBP1P53297 MET22YOL064C 1074 nt7.16□□□□□ -1.26
PBP1P53297 OLA1YBR025C 1185 nt7.16□□□□□ -1.26
PBP1P53297 DPB2YPR175W 2070 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 RAI1YGL246C 1164 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 ARC19YKL013C 516 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 PEX12YMR026C 1200 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 MRPL24YMR193W 777 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 PRE2YPR103W 864 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 YPR084WYPR084W 1371 nt7.15□□□□□ -1.26
PBP1P53297 NSE5YML023C 1671 nt7.15□□□□□ -1.27
PBP1P53297 THI3YDL080C 1830 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 HGH1YGR187C 1185 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 MAS2YHR024C 1449 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 DRS1YLL008W 2259 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 UBC12YLR306W 567 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 MIX17YMR002W 471 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 ELP4YPL101W 1371 nt7.14□□□□□ -1.27
PBP1P53297 AGP2YBR132C 1791 nt7.13□□□□□ -1.27
PBP1P53297 PTC7YHR076W 1032 nt7.13□□□□□ -1.27
PBP1P53297 YJR149WYJR149W 1215 nt7.13□□□□□ -1.27
PBP1P53297 YOR041CYOR041C 432 nt7.13□□□□□ -1.27
PBP1P53297 RPS6AYPL090C 711 nt7.13□□□□□ -1.27
PBP1P53297 RPS6BYBR181C 711 nt7.13□□□□□ -1.27
PBP1P53297 PDC6YGR087C 1692 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 SMC5YOL034W 3282 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 MFG1YDL233W 1377 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 KAE1YKR038C 1161 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 SED5YLR026C 1023 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 BXI1YNL305C 894 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 HXT11YOL156W 1704 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 NUP57YGR119C 1626 nt7.12□□□□□ -1.27
PBP1P53297 YIL092WYIL092W 1902 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 ERR3YMR323W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 ERR1YOR393W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 ERR2YPL281C 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 YIR035CYIR035C 765 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 SPE4YLR146C 903 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 YMR253CYMR253C 1245 nt7.11□□□□□ -1.27
PBP1P53297 CMK2YOL016C 1344 nt7.1□□□□□ -1.27
PBP1P53297 RNA170RNA170 169 nt7.1□□□□□ -1.27
PBP1P53297 YMR206WYMR206W 942 nt7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73 ms