Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CENPBP07199 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CENPBP07199 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CENPBP07199 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CENPBP07199 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CENPBP07199 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CENPBP07199 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CENPBP07199 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CENPBP07199 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CENPBP07199 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CENPBP07199 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CENPBP07199 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CENPBP07199 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CENPBP07199 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CENPBP07199 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CENPBP07199 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CENPBP07199 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CENPBP07199 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CENPBP07199 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CENPBP07199 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CENPBP07199 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CENPBP07199 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CENPBP07199 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CENPBP07199 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CENPBP07199 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CENPBP07199 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CENPBP07199 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CENPBP07199 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CENPBP07199 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CENPBP07199 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CENPBP07199 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CENPBP07199 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CENPBP07199 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CENPBP07199 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CENPBP07199 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CENPBP07199 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CENPBP07199 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CENPBP07199 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CENPBP07199 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CENPBP07199 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CENPBP07199 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CENPBP07199 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CENPBP07199 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CENPBP07199 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CENPBP07199 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CENPBP07199 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CENPBP07199 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CENPBP07199 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CENPBP07199 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CENPBP07199 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CENPBP07199 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CENPBP07199 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CENPBP07199 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CENPBP07199 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CENPBP07199 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CENPBP07199 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CENPBP07199 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CENPBP07199 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CENPBP07199 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CENPBP07199 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CENPBP07199 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CENPBP07199 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CENPBP07199 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CENPBP07199 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CENPBP07199 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CENPBP07199 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CENPBP07199 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CENPBP07199 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CENPBP07199 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CENPBP07199 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CENPBP07199 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CENPBP07199 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CENPBP07199 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CENPBP07199 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CENPBP07199 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CENPBP07199 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CENPBP07199 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPBP07199 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPBP07199 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPBP07199 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPBP07199 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPBP07199 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPBP07199 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPBP07199 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPBP07199 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPBP07199 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPBP07199 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPBP07199 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPBP07199 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPBP07199 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPBP07199 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPBP07199 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPBP07199 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CENPBP07199 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms