Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A1O15245 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A1O15245 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A1O15245 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms