RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 KCNQ2O43526 872 aa30.44■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 EYA1Q99502 592 aa30.44■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 NBPF14Q5TI25 921 aa30.4■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
SYT6-210ENST00000641643 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.37■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.37■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.36■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 NCAPD2Q15021 1401 aa30.36■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 NHSQ6T4R5 1651 aa30.35■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 SPG7Q9UQ90 795 aa30.34■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 MTHFSP49914 203 aa30.32■■■□□ 2.45
SYT6-210ENST00000641643 RREB1Q92766 1687 aa30.32■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.32■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa30.31■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.31■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 TXNRD1Q16881 649 aa30.31■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.3■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 PROM2Q8N271 834 aa30.29■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 CYP27B1O15528 508 aa30.28■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.28■■■□□ 2.44
SYT6-210ENST00000641643 IL13P35225 146 aa30.25■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 BTAF1O14981 1849 aa30.25■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.23■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.22■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.22■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.22■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.22■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.2■■■□□ 2.43
SYT6-210ENST00000641643 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 STK32BQ9NY57 414 aa30.2■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.19■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.19■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 PHKG2P15735 406 aa30.18■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.17■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 KDRP35968 1356 aa30.15■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 SLC15A2Q16348 729 aa30.14■■■□□ 2.42
SYT6-210ENST00000641643 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 CFAP53Q96M91 514 aa30.13■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.12■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 HMOX1P09601 288 aa30.11■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.11■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.11■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 PIGBQ92521 554 aa30.09■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 PPP2R1AP30153 589 aa30.08■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SYT6-210ENST00000641643 DCAF5Q96JK2 942 aa30.07■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 KCNQ4P56696 695 aa30.07■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 PALLDQ8WX93 1383 aa30.06■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.05■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 LRP5O75197 1615 aa30.04■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.03■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 ITGB4P16144 1822 aa30.03■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 SPON1Q9HCB6 807 aa30.03■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 NUDCQ9Y266 331 aa30.03■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 ZNF827Q17R98 1081 aa30.02■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 LY75O60449 1722 aa30.01■■■□□ 2.4
SYT6-210ENST00000641643 PAPPAQ13219 1627 aa30.01■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 AKT1S1Q96B36 256 aa30■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 CABP4P57796 275 aa29.99■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.99■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.99■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB7AO95365 584 aa29.97■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.97■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SYT6-210ENST00000641643 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.94■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 SIK1P57059 783 aa29.94■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 ATG3Q9NT62 314 aa29.94■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 CASZ1Q86V15 1759 aa29.92■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 RALBP1Q15311 655 aa29.92■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 MTFR1LQ9H019 292 aa29.92■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.91■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.9■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 ATP6V1AP38606 617 aa29.9■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.89■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 PRKAR2BP31323 418 aa29.89■■■□□ 2.38
SYT6-210ENST00000641643 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
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