RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.12■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.12■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 AMPHP49418 695 aa23.12■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 UTRNP46939 3433 aa23.12■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.11■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 NBPF4Q96M43 638 aa23.11■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.1■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.09■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.09■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.08■■□□□ 1.29
CLN3-255ENST00000637100 INSRP06213 1382 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 TMF1P82094 1093 aa23.07■■□□□ 1.28
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CLN3-255ENST00000637100 CHD4Q14839 1912 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 USP47Q96K76 1375 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 KCNQ4P56696 695 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 NCAPD2Q15021 1401 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 POLD1P28340 1107 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN3-255ENST00000637100 CDCA8Q53HL2 280 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 FLT4P35916 1363 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 CARD14Q9BXL6 1004 aa23■■□□□ 1.27
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CLN3-255ENST00000637100 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 CYP27B1O15528 508 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-255ENST00000637100 GPR162Q16538 588 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.92■■□□□ 1.26
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CLN3-255ENST00000637100 PALLDQ8WX93 1383 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 C5P01031 1676 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-255ENST00000637100 C1QTNF8P60827 252 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-255ENST00000637100 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-255ENST00000637100 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.88■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.87■■□□□ 1.25
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CLN3-255ENST00000637100 ITGB4P16144 1822 aa22.87■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 PIGBQ92521 554 aa22.86■■□□□ 1.25
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CLN3-255ENST00000637100 C4BP0C0L5 1744 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 EYA1Q99502 592 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 POLKQ9UBT6 870 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 SPG7Q9UQ90 795 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN3-255ENST00000637100 MSH5O43196 834 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN3-255ENST00000637100 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN3-255ENST00000637100 MSL1Q68DK7 614 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-255ENST00000637100 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN3-255ENST00000637100 SSFA2P28290 1259 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN3-255ENST00000637100 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN3-255ENST00000637100 SIK1P57059 783 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN3-255ENST00000637100 IFFO2Q5TF58 517 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN3-255ENST00000637100 ITPK1Q13572 414 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 ADCY9O60503 1353 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 ATG3Q9NT62 314 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 KDRP35968 1356 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 SMIM5Q71RC9 77 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN3-255ENST00000637100 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.7■■□□□ 1.22
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