RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD4Q14839 1912 aa38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MSH5O43196 834 aa38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLN1P23142 703 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NLGN2Q8NFZ4 835 aa38.55■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 DOT1LQ8TEK3 1739 aa38.53■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NSD2O96028 1365 aa38.53■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 MEGF6O75095 1541 aa38.52■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 QSER1Q2KHR3 1735 aa38.52■■■■□ 3.76
CAPNS1-217ENST00000629983 USP47Q96K76 1375 aa38.5■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 USHBP1Q8N6Y0 703 aa38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa38.46■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TESK2Q96S53 571 aa38.46■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RTL1A6NKG5 1358 aa38.45■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MSL1Q68DK7 614 aa38.45■■■■□ 3.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF6Q5VWK0 638 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF4Q96M43 638 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 LY75O60449 1722 aa38.41■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN3BO60391 1043 aa38.41■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC24A1O60721 1099 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TATP17735 454 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GGNBP2Q9H3C7 697 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CGNL1Q0VF96 1302 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 COL24A1Q17RW2 1714 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-217ENST00000629983 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.734e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SHANK3Q9BYB0 1731 aa38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-217ENST00000629983 RGPD2P0DJD1 1756 aa38.36■■■■□ 3.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FYB1O15117 783 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PALLDQ8WX93 1383 aa38.31■■■■□ 3.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa38.29■■■■□ 3.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FLAD1Q8NFF5 587 aa38.29■■■■□ 3.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TMF1P82094 1093 aa38.28■■■■□ 3.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa38.28■■■■□ 3.72
CAPNS1-217ENST00000629983 INSRP06213 1382 aa38.25■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 FLT4P35916 1363 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 AK7Q96M32 723 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CD2APQ9Y5K6 639 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP10DQ9P241 1426 aa38.22■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 C5P01031 1676 aa38.21■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP27B1O15528 508 aa38.19■■■■□ 3.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF14O94880 888 aa38.19■■■■□ 3.7
CAPNS1-217ENST00000629983 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF24Q5T7B8 1368 aa38.15■■■■□ 3.7
CAPNS1-217ENST00000629983 WWC3Q9ULE0 1092 aa38.14■■■■□ 3.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA8Q53HL2 280 aa38.13■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa38.13■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM5Q71RC9 77 aa38.11■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGBQ92521 554 aa38.1■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 NSD3Q9BZ95 1437 aa38.1■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 C4BP0C0L5 1744 aa38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 AMIGO3Q86WK7 504 aa38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SPG7Q9UQ90 795 aa38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF1Q8N6C5 1336 aa38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF20BQ96Q89 1820 aa38.07■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa38.05■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF1LQ8IZX4 1826 aa38.04■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SSFA2P28290 1259 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SIK1P57059 783 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TMOD3Q9NYL9 352 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00116Q8NCU8 138 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 CARD14Q9BXL6 1004 aa38.01■■■■□ 3.68
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCY9O60503 1353 aa38■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GNPATO15228 680 aa37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 IFFO2Q5TF58 517 aa37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD1L3Q7Z443 1732 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB4P16144 1822 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1AP38606 617 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 EYA1Q99502 592 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ASAP1Q9ULH1 1129 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAPD2Q15021 1401 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-217ENST00000629983 UBR3Q6ZT12 1888 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA6P17066 643 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPK1Q13572 414 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNL2Q8IZJ0 200 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP350Q5VT06 3117 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PHKG2P15735 406 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP10P09238 476 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG3Q9NT62 314 aa37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
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