RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617215.1

BX640515.1-201, humanhuman

BASIC

Gene BX640515.1, Length 977 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BX640515.1-201ENST00000617215 NSD2O96028 1365 aa24.32■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 MEGF6O75095 1541 aa24.32■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.32■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 LY75O60449 1722 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 TMF1P82094 1093 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 NBPF4Q96M43 638 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 CHD4Q14839 1912 aa24.31■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.3■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.3■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 POLD1P28340 1107 aa24.29■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.29■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 KCNQ4P56696 695 aa24.27■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 USP47Q96K76 1375 aa24.27■■□□□ 1.48
BX640515.1-201ENST00000617215 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.26■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.26■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 CDCA8Q53HL2 280 aa24.25■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 INSRP06213 1382 aa24.25■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.24■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.23■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 FLT4P35916 1363 aa24.22■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 GPR162Q16538 588 aa24.22■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.22■■□□□ 1.47
BX640515.1-201ENST00000617215 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.2■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.18■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 KLHL34Q8N239 644 aa24.17■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.16■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 CYP27B1O15528 508 aa24.15■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.15■■□□□ 1.46
BX640515.1-201ENST00000617215 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.14■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 NCAPD2Q15021 1401 aa24.13■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 PALLDQ8WX93 1383 aa24.13■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 MSH5O43196 834 aa24.12■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.12■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 C5P01031 1676 aa24.11■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 C1QTNF8P60827 252 aa24.11■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.11■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.11■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.1■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.1■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 GRIN3BO60391 1043 aa24.09■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.09■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.09■■□□□ 1.45
BX640515.1-201ENST00000617215 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.07■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 ITGB4P16144 1822 aa24.07■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.07■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.07■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 MSL1Q68DK7 614 aa24.06■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 PIGBQ92521 554 aa24.06■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 SPG7Q9UQ90 795 aa24.06■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 C4BP0C0L5 1744 aa24.04■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 EYA1Q99502 592 aa24.03■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 AK7Q96M32 723 aa24.02■■□□□ 1.44
BX640515.1-201ENST00000617215 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.01■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 POLKQ9UBT6 870 aa24.01■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.99■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.99■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 SIK1P57059 783 aa23.99■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.99■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 SSFA2P28290 1259 aa23.98■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.98■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.97■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.97■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 PHKG2P15735 406 aa23.96■■□□□ 1.43
BX640515.1-201ENST00000617215 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.95■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.94■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 PHF14O94880 888 aa23.93■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 ITPK1Q13572 414 aa23.92■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 ATP6V1AP38606 617 aa23.91■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 SMIM5Q71RC9 77 aa23.91■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 ATG3Q9NT62 314 aa23.91■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 ATP10DQ9P241 1426 aa23.9■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.89■■□□□ 1.42
BX640515.1-201ENST00000617215 GNPATO15228 680 aa23.89■■□□□ 1.41
BX640515.1-201ENST00000617215 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.88■■□□□ 1.41
BX640515.1-201ENST00000617215 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms