RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-215ENST00000612980 DLL1O00548 723 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 PRAM1Q96QH2 718 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 BCS1LQ9Y276 419 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 ITSN1Q15811 1721 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 VEGFBP49765 207 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 SBF1O95248 1867 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 C5P01031 1676 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 SOX10P56693 466 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 CREBZFQ9NS37 354 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 TSKSQ9UJT2 592 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.77□□□□□ -1.32
RDM1-215ENST00000612980 PIK3C2GO75747 1445 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 LTBP1Q14766 1721 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 POTEIP0CG38 1075 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 POTEJP0CG39 1038 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 RNF181Q9P0P0 153 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 A0A0G2JLW4 131 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 EXOC5O00471 708 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 GCP02774 474 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 NSD2O96028 1365 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.75□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 SLIT3O75094 1523 aa6.75□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.75□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.75□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 POTECB2RU33 542 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 FCHSD2O94868 740 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 ABTB2Q8N961 1025 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 RASSF7Q02833 373 aa6.73□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 SIRT1Q96EB6 747 aa6.73□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 PHF14O94880 888 aa6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 DPEP1P16444 411 aa6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 C4BP0C0L5 1744 aa6.72□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
RDM1-215ENST00000612980 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 RGL3Q3MIN7 710 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 POGKQ9P215 609 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 ACEP12821 1306 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.7□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 KCNA3P22001 575 aa6.7□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 DGKZQ13574 1117 aa6.7□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 PASKQ96RG2 1323 aa6.7□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 ROCK1Q13464 1354 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 CCDC7Q96M83 1385 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 GLTPD2A6NH11 291 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 DCAF5Q96JK2 942 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 ADGRB1O14514 1584 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 MEGF6O75095 1541 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 SOX12O15370 315 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 MMP10P09238 476 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 CHADLQ6NUI6 762 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 NLRP13Q86W25 1043 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 MPNDQ8N594 471 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.67□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 C4AP0C0L4 1744 aa6.67□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 RASSF10A6NK89 507 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 IL2RBP14784 551 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 TGFB2P61812 414 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-215ENST00000612980 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms