RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597020.5

AP2S1-204, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP2S1, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-204ENST00000597020 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.9■■□□□ 1.58
AP2S1-204ENST00000597020 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
AP2S1-204ENST00000597020 TESK2Q96S53 571 aa24.9■■□□□ 1.58
AP2S1-204ENST00000597020 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.9■■□□□ 1.58
AP2S1-204ENST00000597020 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
AP2S1-204ENST00000597020 RTL1A6NKG5 1358 aa24.89■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.87■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 GPR162Q16538 588 aa24.87■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 KLHL34Q8N239 644 aa24.85■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.85■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.84■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 TMF1P82094 1093 aa24.84■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 USP47Q96K76 1375 aa24.83■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.83■■□□□ 1.57
AP2S1-204ENST00000597020 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 MEGF6O75095 1541 aa24.81■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 FBLN1P23142 703 aa24.81■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 CDCA8Q53HL2 280 aa24.8■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 NSD2O96028 1365 aa24.8■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 FYB1O15117 783 aa24.79■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 KCNQ4P56696 695 aa24.78■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.78■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 NBPF4Q96M43 638 aa24.78■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.78■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 C5P01031 1676 aa24.78■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.77■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 MSH5O43196 834 aa24.77■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
AP2S1-204ENST00000597020 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.76■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.76■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.76■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 INSRP06213 1382 aa24.75■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 ITGB4P16144 1822 aa24.75■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.74■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 FLT4P35916 1363 aa24.74■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.73■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 C1QTNF8P60827 252 aa24.72■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 GRIN3BO60391 1043 aa24.71■■□□□ 1.55
AP2S1-204ENST00000597020 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.7■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.68■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.68■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.67■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.67■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 UTRNP46939 3433 aa24.67■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 PALLDQ8WX93 1383 aa24.67■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 C4BP0C0L5 1744 aa24.64■■□□□ 1.54
AP2S1-204ENST00000597020 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.63■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.63■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.62■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 MSL1Q68DK7 614 aa24.62■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 AK7Q96M32 723 aa24.62■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 SPG7Q9UQ90 795 aa24.62■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.61■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 CYP27B1O15528 508 aa24.61■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.59■■□□□ 1.53
AP2S1-204ENST00000597020 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.532e-8■■■□□ 18.1
AP2S1-204ENST00000597020 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.57■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 NCAPD2Q15021 1401 aa24.56■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.56■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 PIGBQ92521 554 aa24.54■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.54■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 SSFA2P28290 1259 aa24.53■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.53■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.52■■□□□ 1.52
AP2S1-204ENST00000597020 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.51■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 PHF14O94880 888 aa24.51■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 SIK1P57059 783 aa24.51■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 EYA1Q99502 592 aa24.5■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.48■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 ATP10DQ9P241 1426 aa24.47■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 ATP6V1AP38606 617 aa24.47■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 PHKG2P15735 406 aa24.46■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 POLKQ9UBT6 870 aa24.46■■□□□ 1.51
AP2S1-204ENST00000597020 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.45■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.45■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 GNPATO15228 680 aa24.44■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.44■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.43■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.43■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.42■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.41■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.4■■□□□ 1.5
AP2S1-204ENST00000597020 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms