RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592175.5

KDM4B-210, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 4

Gene KDM4B, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-210ENST00000592175 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
KDM4B-210ENST00000592175 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
KDM4B-210ENST00000592175 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.33■■□□□ 1.17
KDM4B-210ENST00000592175 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.33■■□□□ 1.17
KDM4B-210ENST00000592175 KCNQ2O43526 872 aa22.32■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 NCAPD2Q15021 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.31■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.31■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.29■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.29■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.27■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 TXNRD1Q16881 649 aa22.27■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 PROM2Q8N271 834 aa22.27■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 EYA1Q99502 592 aa22.27■■□□□ 1.16
KDM4B-210ENST00000592175 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.26■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 LRP5O75197 1615 aa22.24■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.24■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 SPG7Q9UQ90 795 aa22.24■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.24■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 BTAF1O14981 1849 aa22.22■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
KDM4B-210ENST00000592175 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.2■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.2■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 CYP27B1O15528 508 aa22.19■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 STK32BQ9NY57 414 aa22.19■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.18■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 SLC15A2Q16348 729 aa22.16■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KDM4B-210ENST00000592175 MTHFSP49914 203 aa22.14■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.14■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.13■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 SPON1Q9HCB6 807 aa22.13■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 IL13P35225 146 aa22.12■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.12■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 PHKG2P15735 406 aa22.11■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 KDRP35968 1356 aa22.11■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 PAPPAQ13219 1627 aa22.1■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.08■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
KDM4B-210ENST00000592175 LY75O60449 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 CASZ1Q86V15 1759 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 AKT1S1Q96B36 256 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 DCAF5Q96JK2 942 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 PALLDQ8WX93 1383 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 PIGBQ92521 554 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF827Q17R98 1081 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 MTFR1LQ9H019 292 aa22.03■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 ITGB4P16144 1822 aa22.03■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.02■■□□□ 1.12
KDM4B-210ENST00000592175 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.01■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 ZBTB7AO95365 584 aa22■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 KCNQ4P56696 695 aa22■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 CFAP53Q96M91 514 aa22■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.98■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.97■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.97■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 HMOX1P09601 288 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 PTGER2P43116 358 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 SIK1P57059 783 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 CABP4P57796 275 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
KDM4B-210ENST00000592175 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.95■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 C5P01031 1676 aa21.95■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 PPP2R1AP30153 589 aa21.94■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 ATG3Q9NT62 314 aa21.94■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 NUDCQ9Y266 331 aa21.94■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.93■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 AK7Q96M32 723 aa21.91■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.9■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 ATP6V1AP38606 617 aa21.9■■□□□ 1.1
KDM4B-210ENST00000592175 POLD1P28340 1107 aa21.89■■□□□ 1.09
KDM4B-210ENST00000592175 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.89■■□□□ 1.09
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