RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa36.01■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT6BQ8WYB5 2073 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FYB1O15117 783 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GGNBP2Q9H3C7 697 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 UTRNP46939 3433 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 QSER1Q2KHR3 1735 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF6Q5VWK0 638 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF4Q96M43 638 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A10Q8TF71 515 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 USP47Q96K76 1375 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TMF1P82094 1093 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 USHBP1Q8N6Y0 703 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LY75O60449 1722 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 POLD1P28340 1107 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 COL24A1Q17RW2 1714 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL34Q8N239 644 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 INSRP06213 1382 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR162Q16538 588 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FLT4P35916 1363 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD4Q14839 1912 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCA8Q53HL2 280 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MSH5O43196 834 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP27B1O15528 508 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PALLDQ8WX93 1383 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C5P01031 1676 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MSL1Q68DK7 614 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAPD2Q15021 1401 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-211ENST00000590874 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.34e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF8P60827 252 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 AMIGO3Q86WK7 504 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGBQ92521 554 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C4BP0C0L5 1744 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FLAD1Q8NFF5 587 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB4P16144 1822 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 EYA1Q99502 592 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 AK7Q96M32 723 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SPG7Q9UQ90 795 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM5Q71RC9 77 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIN3BO60391 1043 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 POLKQ9UBT6 870 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF14O94880 888 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SIK1P57059 783 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00116Q8NCU8 138 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UBR3Q6ZT12 1888 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PHKG2P15735 406 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TMOD3Q9NYL9 352 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ASAP1Q9ULH1 1129 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SSFA2P28290 1259 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPK1Q13572 414 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG3Q9NT62 314 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP10DQ9P241 1426 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GNPATO15228 680 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1AP38606 617 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF1Q8N6C5 1336 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-211ENST00000590874 WWC3Q9ULE0 1092 aa35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms