RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.23■■■□□ 2.11
ILF3-215ENST00000589485 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ILF3-215ENST00000589485 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.22■■■□□ 2.11
ILF3-215ENST00000589485 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.21■■■□□ 2.11
ILF3-215ENST00000589485 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
ILF3-215ENST00000589485 KCNQ2O43526 872 aa28.19■■■□□ 2.1
ILF3-215ENST00000589485 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ILF3-215ENST00000589485 PLSCR1O15162 318 aa28.18■■■□□ 2.1
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ILF3-215ENST00000589485 EYA1Q99502 592 aa28.17■■■□□ 2.1
ILF3-215ENST00000589485 BTAF1O14981 1849 aa28.16■■■□□ 2.1
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ILF3-215ENST00000589485 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.13■■■□□ 2.09
ILF3-215ENST00000589485 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.12■■■□□ 2.09
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ILF3-215ENST00000589485 TXNRD1Q16881 649 aa28.07■■■□□ 2.08
ILF3-215ENST00000589485 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.07■■■□□ 2.08
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ILF3-215ENST00000589485 PROM2Q8N271 834 aa28.04■■■□□ 2.08
ILF3-215ENST00000589485 CYP27B1O15528 508 aa28.03■■■□□ 2.08
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ILF3-215ENST00000589485 ITGB4P16144 1822 aa27.98■■■□□ 2.07
ILF3-215ENST00000589485 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.98■■■□□ 2.07
ILF3-215ENST00000589485 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
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ILF3-215ENST00000589485 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.97■■■□□ 2.07
ILF3-215ENST00000589485 STK32BQ9NY57 414 aa27.97■■■□□ 2.07
ILF3-215ENST00000589485 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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ILF3-215ENST00000589485 LY75O60449 1722 aa27.94■■■□□ 2.06
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ILF3-215ENST00000589485 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.92■■■□□ 2.06
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ILF3-215ENST00000589485 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
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ILF3-215ENST00000589485 ZNF827Q17R98 1081 aa27.82■■■□□ 2.04
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ILF3-215ENST00000589485 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.76■■■□□ 2.03
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ILF3-215ENST00000589485 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
ILF3-215ENST00000589485 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.71■■■□□ 2.03
ILF3-215ENST00000589485 SIK1P57059 783 aa27.71■■■□□ 2.03
ILF3-215ENST00000589485 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
ILF3-215ENST00000589485 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
ILF3-215ENST00000589485 MTFR1LQ9H019 292 aa27.7■■■□□ 2.02
ILF3-215ENST00000589485 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.69■■■□□ 2.02
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