RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 SPON1Q9HCB6 807 aa31.01■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 STK32BQ9NY57 414 aa31.01■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 MEGF6O75095 1541 aa30.99■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 BTAF1O14981 1849 aa30.98■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 SLC15A2Q16348 729 aa30.96■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 PANK3Q9H999 370 aa30.96■■■□□ 2.55
CLN3-232ENST00000568443 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CLN3-232ENST00000568443 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CLN3-232ENST00000568443 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.92■■■□□ 2.54
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CLN3-232ENST00000568443 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CLN3-232ENST00000568443 POLKQ9UBT6 870 aa30.91■■■□□ 2.54
CLN3-232ENST00000568443 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.89■■■□□ 2.54
CLN3-232ENST00000568443 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.88■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 ZBTB7AO95365 584 aa30.87■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.87■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.87■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.87■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 CASZ1Q86V15 1759 aa30.86■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.85■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.85■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 EYA1Q99502 592 aa30.83■■■□□ 2.53
CLN3-232ENST00000568443 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
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CLN3-232ENST00000568443 CYP27B1O15528 508 aa30.8■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 ZNF827Q17R98 1081 aa30.8■■■□□ 2.52
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CLN3-232ENST00000568443 MORC1Q86VD1 984 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 MTFR1LQ9H019 292 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 SPG7Q9UQ90 795 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 PAPPAQ13219 1627 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 KCNQ4P56696 695 aa30.78■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 NCAPD2Q15021 1401 aa30.78■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 AKT1S1Q96B36 256 aa30.77■■■□□ 2.52
CLN3-232ENST00000568443 PTGER2P43116 358 aa30.76■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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CLN3-232ENST00000568443 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.73■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.73■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 LY75O60449 1722 aa30.72■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.72■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CLN3-232ENST00000568443 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.69■■■□□ 2.5
CLN3-232ENST00000568443 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.67■■■□□ 2.5
CLN3-232ENST00000568443 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.67■■■□□ 2.5
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CLN3-232ENST00000568443 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.66■■■□□ 2.5
CLN3-232ENST00000568443 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
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CLN3-232ENST00000568443 PIGBQ92521 554 aa30.64■■■□□ 2.5
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CLN3-232ENST00000568443 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.61■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 SYT17Q9BSW7 474 aa30.6■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.6■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.6■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 MSH5O43196 834 aa30.58■■■□□ 2.49
CLN3-232ENST00000568443 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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CLN3-232ENST00000568443 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.55■■■□□ 2.48
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CLN3-232ENST00000568443 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
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CLN3-232ENST00000568443 C5P01031 1676 aa30.54■■■□□ 2.48
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CLN3-232ENST00000568443 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.53■■■□□ 2.48
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CLN3-232ENST00000568443 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CLN3-232ENST00000568443 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.52■■■□□ 2.48
CLN3-232ENST00000568443 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.51■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 SIK1P57059 783 aa30.51■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 FLAD1Q8NFF5 587 aa30.51■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 DCAF5Q96JK2 942 aa30.51■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.5■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.5■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 AK7Q96M32 723 aa30.5■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.48■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 MAP3K5Q99683 1374 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 YY1P25490 414 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 KLHL34Q8N239 644 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 ATG3Q9NT62 314 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 KDRP35968 1356 aa30.45■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 ATP6V1AP38606 617 aa30.45■■■□□ 2.47
CLN3-232ENST00000568443 C4BP0C0L5 1744 aa30.44■■■□□ 2.46
CLN3-232ENST00000568443 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.44■■■□□ 2.46
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