RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, human

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	HMOX1	P09601	288 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SBF2	Q86WG5	1849 aa		28.13	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KDR	P35968	1356 aa		28.13	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TRIM37	O94972	964 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.08	■■■□□ 2.09
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BCL9	O00512	1426 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.07	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CYP27B1	O15528	508 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ANP32C	O43423	234 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KCNQ2	O43526	872 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PHKG2	P15735	406 aa		28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	APBA3	O96018	575 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PRKAR2B	P31323	418 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BAG6	P46379	1132 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.95	■■■□□ 2.07
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FCHSD2	O94868	740 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BTAF1	O14981	1849 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ITGB4	P16144	1822 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CCNDBP1-208	ENST00000566515	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.89	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.89	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.87	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PLSCR1	O15162	318 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PIGB	Q92521	554 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NEFM	P07197	916 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RREB1	Q92766	1687 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CABP4	P57796	275 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PROM2	Q8N271	834 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TXNRD1	Q16881	649 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	LY75	O60449	1722 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KCNQ4	P56696	695 aa		27.71	■■■□□ 2.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms