RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 FLT4P35916 1363 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 MEGF6O75095 1541 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 INSRP06213 1382 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 CASZ1Q86V15 1759 aa35.01■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
PPP4C-208ENST00000564966 KIF24Q5T7B8 1368 aa35■■■■□ 3.19
PPP4C-208ENST00000564966 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.98■■■■□ 3.19
PPP4C-208ENST00000564966 DCAF8L1A6NGE4 600 aa34.95■■■■□ 3.19
PPP4C-208ENST00000564966 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 LRRC4BQ9NT99 713 aa34.94■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.94■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 SLC27A3Q5K4L6 730 aa34.92■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.9■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.9■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF827Q17R98 1081 aa34.9■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 MTFR1LQ9H019 292 aa34.9■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 KCNQ4P56696 695 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP4C-208ENST00000564966 PAPPAQ13219 1627 aa34.88■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 PANK3Q9H999 370 aa34.86■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 PTGER2P43116 358 aa34.85■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.84■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa34.84■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 NSD2O96028 1365 aa34.84■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 POLKQ9UBT6 870 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP4C-208ENST00000564966 AKT1S1Q96B36 256 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.8■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 EYA1Q99502 592 aa34.79■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 SPG7Q9UQ90 795 aa34.79■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 CYP27B1O15528 508 aa34.78■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 LY75O60449 1722 aa34.77■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
PPP4C-208ENST00000564966 MSH5O43196 834 aa34.75■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 ARXQ96QS3 562 aa34.75■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 MORC1Q86VD1 984 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 YY1P25490 414 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 KLHL34Q8N239 644 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 SGIP1Q9BQI5 828 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 POLD1P28340 1107 aa34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 SLC16A10Q8TF71 515 aa34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 SYT17Q9BSW7 474 aa34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 NCAPD2Q15021 1401 aa34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-208ENST00000564966 PALLDQ8WX93 1383 aa34.69■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.67■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.66■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa34.65■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 IFNL2Q8IZJ0 200 aa34.64■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34.64■■■■□ 3.14
PPP4C-208ENST00000564966 ITGB4P16144 1822 aa34.63■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 PIGBQ92521 554 aa34.62■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 TMOD3Q9NYL9 352 aa34.62■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 C5P01031 1676 aa34.6■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 PHKG2P15735 406 aa34.6■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.58■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.57■■■■□ 3.13
PPP4C-208ENST00000564966 AK7Q96M32 723 aa34.56■■■■□ 3.12
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PPP4C-208ENST00000564966 MSL1Q68DK7 614 aa34.54■■■■□ 3.12
PPP4C-208ENST00000564966 FLAD1Q8NFF5 587 aa34.52■■■■□ 3.12
PPP4C-208ENST00000564966 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
PPP4C-208ENST00000564966 TAF1LQ8IZX4 1826 aa34.51■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 MAP3K5Q99683 1374 aa34.5■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 PHF14O94880 888 aa34.5■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 ASAP1Q9ULH1 1129 aa34.5■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa34.49■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 SIK1P57059 783 aa34.49■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 GPR162Q16538 588 aa34.49■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 C4BP0C0L5 1744 aa34.48■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.48■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.47■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 ATP6V1AP38606 617 aa34.46■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.46■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa34.46■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.45■■■■□ 3.11
PPP4C-208ENST00000564966 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 DCAF5Q96JK2 942 aa34.44■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.44■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 LINC00116Q8NCU8 138 aa34.43■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 ATG3Q9NT62 314 aa34.43■■■■□ 3.1
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