RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548480.1

SLC25A3-210, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A3, Length 722 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-210ENST00000548480 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.76□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.76□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.76□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 USP4Q13107 963 aa5.75□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 A0A1W2PRU2 124 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 TREML4Q6UXN2 200 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 SIRT1Q96EB6 747 aa5.74□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 PIK3CDO00329 1044 aa5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 GNRH1P01148 92 aa5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 RNF217Q8TC41 542 aa5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.73□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 MEN1O00255 615 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 WFS1O76024 890 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 SKIP12755 728 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 CLN3Q13286 438 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 NLRP3Q96P20 1036 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.72□□□□□ -1.49
SLC25A3-210ENST00000548480 H3BM21 787 aa5.71□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 GPC1P35052 558 aa5.71□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.71□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.71□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 PTSQ03393 145 aa5.7□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.7□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 GLMNQ92990 594 aa5.7□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 CNKSR1Q969H4 720 aa5.7□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 XAGE2Q96GT9 111 aa5.7□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.7□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 USP17L5A8MUK1 530 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 PPFIA3O75145 1194 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 IL2RAP01589 272 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 VEGFBP49765 207 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 EML3Q32P44 896 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 UCN2Q96RP3 112 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 NOD1Q9Y239 953 aa5.69□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 SLC35F4A4IF30 521 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ATP9BO43861 1147 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 CENPCQ03188 943 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 NCOA4Q13772 614 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.68□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa5.67□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 LCE2CQ5TA81 110 aa5.67□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.67□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 IRF7Q92985 503 aa5.67□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 USP17L3A6NCW0 530 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 USP17L4A6NCW7 530 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 WASLO00401 505 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 INHAP05111 366 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 RHOQP17081 205 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 SCNN1DP51172 638 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 GDF10P55107 478 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 GTF2IP78347 998 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 POU4F2Q12837 409 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 WDR44Q5JSH3 913 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ZMYND15Q9H091 742 aa5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 VSIG8P0DPA2 414 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 TRIM50Q86XT4 487 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 NBPF15Q8N660 670 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC25A3-210ENST00000548480 ERBB4Q15303 1308 aa5.65□□□□□ -1.51
SLC25A3-210ENST00000548480 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC25A3-210ENST00000548480 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC25A3-210ENST00000548480 WIPF1O43516 503 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC25A3-210ENST00000548480 ITGA6P23229 1130 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.4 ms