RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 REC8O95072 547 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 LRSAM1Q6UWE0 723 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 TSPYL6Q8N831 410 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 PRAM1Q96QH2 718 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 RBSNQ9H1K0 784 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 MCM2P49736 904 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 CCDC39Q9UFE4 941 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 IL13P35225 146 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 IDI1Q13907 227 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 CDK19Q9BWU1 502 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 RGS12O14924 1447 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 KIAA0232Q92628 1395 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 STK26Q9P289 416 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 RICTORQ6R327 1708 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 PTPRCP08575 1304 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 DYNC1I1O14576 645 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 NCLP19338 710 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 SDSP20132 328 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 GPT2Q8TD30 523 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 AKAP12Q02952 1782 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 ERC2O15083 957 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 CEP85Q6P2H3 762 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 KLHL34Q8N239 644 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 CABP1Q9NZU7 370 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-202ENST00000542324 RTL1A6NKG5 1358 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 ZDHHC9Q9Y397 364 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 SSH2Q76I76 1423 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 IL17RAQ96F46 866 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 C3P01024 1663 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 ITSN1Q15811 1721 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 HMMRO75330 724 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 HMOX1P09601 288 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 CUL4AQ13619 759 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 ANAPC15P60006 121 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 UQCRHLA0A096LP55 91 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 PHF14O94880 888 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 BRD1O95696 1058 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 UQCRHP07919 91 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 PKP1Q13835 747 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 MSH6P52701 1360 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 MCCP23508 829 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 UVSSAQ2YD98 709 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 FAM184AQ8NB25 1140 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 TSPY26PQ9H489 355 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 SYCE3A1L190 88 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 TMX3Q96JJ7 454 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 ARHGEF10O15013 1369 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-202ENST00000542324 CHL1O00533 1208 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 SALL3Q9BXA9 1300 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 PDE1AP54750 535 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 AOX1Q06278 1338 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 COG3Q96JB2 828 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 CPS1P31327 1500 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 NEK4P51957 841 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
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