RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM5Q71RC9 77 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF14O94880 888 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFAT5O94916 1531 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAC3Q96MF2 364 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCS1LQ9Y276 419 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSD2O96028 1365 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP47Q96K76 1375 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LY75O60449 1722 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FSTL1Q12841 308 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AK7Q96M32 723 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRAGCQ9HB90 399 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JLW4 131 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NME9Q86XW9 330 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EVC2Q86UK5 1308 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCHSD2O94868 740 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5P01031 1676 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PALLDQ8WX93 1383 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP10P09238 476 aa14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LTN1O94822 1766 aa14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPEP1P16444 411 aa14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM161AQ3B820 660 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IP6K1Q92551 441 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF181Q9P0P0 153 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP54Q70EL1 1684 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGFB2P61812 414 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP31Q70CQ4 1352 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEGF6O75095 1541 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4BP0C0L5 1744 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNPATO15228 680 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSFA2P28290 1259 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBLN1P23142 703 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMC1Q8TDI8 760 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXN1O15353 648 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMPHP49418 695 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXC9P31274 260 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF4Q96M43 638 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNA3P22001 575 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIK1P57059 783 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMF1P82094 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGBQ92521 554 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIM2Q9P1W9 311 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITPK1Q13572 414 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V1AP38606 617 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.3 ms