RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	KDR	P35968	1356 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	BCL9	O00512	1426 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	30.1	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	SPG7	Q9UQ90	795 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	30.09	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	EP400	Q96L91	3159 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	FAM182B	Q5T319	152 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PUF60-222	ENST00000533362	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	ANP32C	O43423	234 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	30.03	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PUF60-222	ENST00000533362	HMOX1	P09601	288 aa		30	■■■□□ 2.39
PUF60-222	ENST00000533362	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	29.98	■■■□□ 2.39
PUF60-222	ENST00000533362	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	29.98	■■■□□ 2.39
PUF60-222	ENST00000533362	TRIM37	O94972	964 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PUF60-222	ENST00000533362	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PUF60-222	ENST00000533362	SBF2	Q86WG5	1849 aa		29.95	■■■□□ 2.39
PUF60-222	ENST00000533362	CYP27B1	O15528	508 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	FCHSD2	O94868	740 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	BAG6	P46379	1132 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	PHKG2	P15735	406 aa		29.91	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	NEFM	P07197	916 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PUF60-222	ENST00000533362	APBA3	O96018	575 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	PRKAR2B	P31323	418 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	29.87	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	DCAF5	Q96JK2	942 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PUF60-222	ENST00000533362	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	KCNQ2	O43526	872 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	PLSCR1	O15162	318 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	BTAF1	O14981	1849 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PUF60-222	ENST00000533362	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	MRS2	Q9HD23	443 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	ITGB4	P16144	1822 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	CABP4	P57796	275 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PUF60-222	ENST00000533362	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	RREB1	Q92766	1687 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	PIGB	Q92521	554 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	MRC1	P22897	1456 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	RUNDC1	Q96C34	613 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	PALLD	Q8WX93	1383 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC184	Q52MB2	194 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PUF60-222	ENST00000533362	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.33
PUF60-222	ENST00000533362	TEF	Q10587	303 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PUF60-222	ENST00000533362	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PUF60-222	ENST00000533362	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PUF60-222	ENST00000533362	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
PUF60-222	ENST00000533362	LY75	O60449	1722 aa		29.62	■■■□□ 2.33

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