RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	LTN1	O94822	1766 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	NSD2	O96028	1365 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP47	Q96K76	1375 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	AMPH	P49418	695 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	HSPA6	P17066	643 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOXC9	P31274	260 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	COG3	Q96JB2	828 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ERLIN2-209	ENST00000521993	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.9	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.9	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993		A0A1W2PP64	1363 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	LY75	O60449	1722 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	ADCY9	O60503	1353 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	MEGF6	O75095	1541 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.83	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.83	□□□□□ -0.19
ERLIN2-209	ENST00000521993	FBLN1	P23142	703 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	AK7	Q96M32	723 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	KIF3C	O14782	793 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	PHF14	O94880	888 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	SSFA2	P28290	1259 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	APLP1	P51693	650 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	C5	P01031	1676 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	FYB1	O15117	783 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYP27B1	O15528	508 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	TESK2	Q96S53	571 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ERLIN2-209	ENST00000521993	INSR	P06213	1382 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	PIGB	Q92521	554 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	TOMM70	O94826	608 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	SIK1	P57059	783 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	FLT4	P35916	1363 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	TGFB2	P61812	414 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	GNPAT	O15228	680 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	MMP10	P09238	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMF1	P82094	1093 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ERLIN2-209	ENST00000521993	ITPK1	Q13572	414 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ERLIN2-209	ENST00000521993	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ERLIN2-209	ENST00000521993	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.9 ms