RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COPS2P61201 443 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGAP4P98171 946 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP4Q13107 963 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGERQ15109 404 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCL11AQ9H165 835 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WEE1P30291 646 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERFEQ4G0M1 354 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLL1O43897 1013 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMP3P54852 163 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC01559Q495D7 138 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BAP1Q92560 729 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXJ1Q92949 421 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STAC3Q96MF2 364 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM205CA6NFA0 338 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB15P59190 212 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL19A1Q14993 1142 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BACH2Q9BYV9 841 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HELQQ8TDG4 1101 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT2BQ93097 391 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MARVELD3Q96A59 401 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 M0R2N6 131 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRO43593 1189 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMC7Q7Z402 723 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF358Q9NW07 568 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WBP1LQ9NX94 342 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESPNB1AK53 854 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM13AO94988 1023 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADH1BP00325 375 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC125Q86Z20 511 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPSTP25325 297 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF511Q8NB15 262 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMC1Q8TDI8 760 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL26A1Q96A83 441 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFB5O43674 189 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGFBP4P22692 258 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBXN4Q92575 508 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXO3O43524 673 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZPR1O75312 459 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCTRP47872 440 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM161BQ96MY7 647 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST18O60284 1047 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPR3P17342 541 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAPK8P45983 427 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AAMPQ13685 434 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNS4Q8IZW8 715 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TREHO43280 583 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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