RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A1W2PP64 1363 aa28.65■■■□□ 2.18
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GRIN3BO60391 1043 aa28.65■■■□□ 2.18
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KLHL34Q8N239 644 aa28.63■■■□□ 2.17
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMC1Q8TDI8 760 aa28.63■■■□□ 2.17
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.63■■■□□ 2.17
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.63■■■□□ 2.17
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.56■■■□□ 2.16
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.54■■■□□ 2.16
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATP10DQ9P241 1426 aa28.52■■■□□ 2.16
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP47Q96K76 1375 aa28.51■■■□□ 2.16
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FBLN1P23142 703 aa28.51■■■□□ 2.15
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 COG3Q96JB2 828 aa28.5■■■□□ 2.15
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NBPF4Q96M43 638 aa28.5■■■□□ 2.15
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RTL1A6NKG5 1358 aa28.49■■■□□ 2.15
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TESK2Q96S53 571 aa28.48■■■□□ 2.15
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.47■■■□□ 2.15
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C5P01031 1676 aa28.47■■■□□ 2.15
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSH5O43196 834 aa28.45■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSL1Q68DK7 614 aa28.45■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.44■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSPA6P17066 643 aa28.4■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PALLDQ8WX93 1383 aa28.39■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FYB1O15117 783 aa28.39■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.39■■■□□ 2.14
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.38■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC24A1O60721 1099 aa28.37■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.37■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.37■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.37■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.37■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INSRP06213 1382 aa28.37■■■□□ 2.13
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.34■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.33■■■□□ 2.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.32■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.32■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITGB4P16144 1822 aa28.3■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NCAPD2Q15021 1401 aa28.3■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.3■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF3CO14782 793 aa28.29■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.29■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 FLT4P35916 1363 aa28.27■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.27■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SSFA2P28290 1259 aa28.27■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AK7Q96M32 723 aa28.27■■■□□ 2.12
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMIM5Q71RC9 77 aa28.24■■■□□ 2.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TONSLQ96HA7 1378 aa28.22■■■□□ 2.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.21■■■□□ 2.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SIK1P57059 783 aa28.21■■■□□ 2.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.21■■■□□ 2.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHF14O94880 888 aa28.19■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.19■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.18■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.18■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITPK1Q13572 414 aa28.17■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.15■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.15■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.15■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 APLP1P51693 650 aa28.14■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.14■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPG7Q9UQ90 795 aa28.14■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.14■■■□□ 2.1
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TGFB2P61812 414 aa28.13■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMF1P82094 1093 aa28.13■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.13■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.12■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOMM70O94826 608 aa28.12■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.12■■■□□ 2.09
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GNPATO15228 680 aa28.1■■■□□ 2.09
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