RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 USP47Q96K76 1375 aa42.39■■■■■ 4.38
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ALYREF-202ENST00000505490 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
ALYREF-202ENST00000505490 ARXQ96QS3 562 aa42.33■■■■■ 4.37
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ALYREF-202ENST00000505490 NBPF4Q96M43 638 aa42.32■■■■■ 4.37
ALYREF-202ENST00000505490 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa42.32■■■■■ 4.36
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ALYREF-202ENST00000505490 SLC16A10Q8TF71 515 aa42.31■■■■■ 4.36
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ALYREF-202ENST00000505490 KIF24Q5T7B8 1368 aa42.27■■■■■ 4.36
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ALYREF-202ENST00000505490 CARD14Q9BXL6 1004 aa42.18■■■■■ 4.34
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ALYREF-202ENST00000505490 PKD1L3Q7Z443 1732 aa42.09■■■■■ 4.33
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ALYREF-202ENST00000505490 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa42.04■■■■■ 4.32
ALYREF-202ENST00000505490 CYP27B1O15528 508 aa42.04■■■■■ 4.32
ALYREF-202ENST00000505490 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa42.04■■■■■ 4.32
ALYREF-202ENST00000505490 ITGB4P16144 1822 aa42.02■■■■■ 4.32
ALYREF-202ENST00000505490 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
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ALYREF-202ENST00000505490 NLGN2Q8NFZ4 835 aa41.92■■■■■ 4.3
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ALYREF-202ENST00000505490 POLKQ9UBT6 870 aa41.86■■■■■ 4.29
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ALYREF-202ENST00000505490 UBR3Q6ZT12 1888 aa41.83■■■■■ 4.29
ALYREF-202ENST00000505490 MSH5O43196 834 aa41.82■■■■■ 4.29
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ALYREF-202ENST00000505490 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP41.76■■■■■ 4.286e-8■□□□□ 11.1
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ALYREF-202ENST00000505490 KDRP35968 1356 aa41.59■■■■■ 4.25
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ALYREF-202ENST00000505490 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
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ALYREF-202ENST00000505490 PANK3Q9H999 370 aa41.58■■■■■ 4.25
ALYREF-202ENST00000505490 PHF14O94880 888 aa41.57■■■■■ 4.25
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