RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 STK17AQ9UEE5 414 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 GPC1P35052 558 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 GMPRP36959 345 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 PTSQ03393 145 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 WASHC4Q2M389 1173 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 RNF217Q8TC41 542 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 PIK3CDO00329 1044 aa6.43□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 WWC1Q8IX03 1113 aa6.43□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 SLC35F4A4IF30 521 aa6.42□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 SOX11P35716 441 aa6.42□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.42□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.42□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 ERBB4Q15303 1308 aa6.42□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.41□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 SIRT1Q96EB6 747 aa6.41□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 NLRP3Q96P20 1036 aa6.41□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.41□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 FLIIQ13045 1269 aa6.4□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.4□□□□□ -1.38
TRBVA-201ENST00000498804 A0A1W2PRU2 124 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 MEN1O00255 615 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 TRAK2O60296 914 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 GNRH1P01148 92 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 ITGA6P23229 1130 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 USP4Q13107 963 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 CLN3Q13286 438 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 GMCL1Q96IK5 515 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 ALG2Q9H553 416 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.39□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 SEMA3FQ13275 785 aa6.38□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.38□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 UCN2Q96RP3 112 aa6.38□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.38□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 RAD21O60216 631 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 WDR44Q5JSH3 913 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 SV2AQ7L0J3 742 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 RNF135Q8IUD6 432 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.37□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.36□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.36□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.35□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.35□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.35□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.35□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 CDC14CA4D256 554 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 H7C1W4 665 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 IL2RAP01589 272 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.34□□□□□ -1.39
TRBVA-201ENST00000498804 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 CNKSR1Q969H4 720 aa6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 XAGE2Q96GT9 111 aa6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.33□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 RHOQP17081 205 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 SCNN1DP51172 638 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 NBPF15Q8N660 670 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.32□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 CENPCQ03188 943 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 POU4F2Q12837 409 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 GNASQ5JWF2 1037 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 GLMNQ92990 594 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRBVA-201ENST00000498804 A6NJR5 290 aa6.3□□□□□ -1.4
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