RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA3	Q99758	1704 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM37	O94972	964 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	APBA3	O96018	575 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MARVELD3	Q96A59	401 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	OXER1	Q8TDS5	423 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	USP35	Q9P2H5	1018 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	NRAP	Q86VF7	1730 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	EVA1C	P58658	441 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE3B	Q13370	1112 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNA2	Q15822	529 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DLC1	Q96QB1	1528 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DISP2	A7MBM2	1401 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRB2	O60241	1585 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	YY1	P25490	414 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK2B	Q13554	666 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF14	Q5TI25	921 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0232	Q92628	1395 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		15.88	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		15.88	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ERBB3	P21860	1342 aa		15.88	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT7	P0C024	238 aa		15.87	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	15.87	■□□□□ 0.13	3e-11	■■■■■ 34.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ALS2	Q96Q42	1657 aa		15.86	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		15.86	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K9	P80192	1104 aa		15.86	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F4	Q16254	413 aa		15.86	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		15.86	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM205C	A6NFA0	338 aa		15.85	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		15.85	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRB1	O14514	1584 aa		15.83	■□□□□ 0.13
SKAP2-209	ENST00000497511	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		15.83	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SPON1	Q9HCB6	807 aa		15.83	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		15.83	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		15.82	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SSH2	Q76I76	1423 aa		15.82	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP7B	P35670	1465 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ABTB2	Q8N961	1025 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK19	Q9BWU1	502 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNQ2	O43526	872 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ACE	P12821	1306 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	STAC3	Q96MF2	364 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	LHX6	Q9UPM6	363 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	EVI5	O60447	810 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP13	Q86W25	1043 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ITSN1	Q15811	1721 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		15.74	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CPD	O75976	1380 aa		15.74	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		15.74	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		15.73	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	GC	P02774	474 aa		15.73	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		15.73	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		15.73	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RREB1	Q92766	1687 aa		15.73	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		15.72	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		15.72	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		15.72	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		15.72	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	DPYSL4	O14531	572 aa		15.72	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		15.71	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	DDB1	Q16531	1140 aa		15.71	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		15.71	■□□□□ 0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	USP19	O94966	1318 aa		15.7	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CRB1	P82279	1406 aa		15.7	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		15.7	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEB3	A0JP26	581 aa		15.69	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PLSCR1	O15162	318 aa		15.69	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB7A	O95365	584 aa		15.69	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEB	Q6S5H4	581 aa		15.69	■□□□□ 0.1

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