RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	KCNQ2	O43526	872 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	PROM2	Q8N271	834 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SERBP1-208	ENST00000493607	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	EYA1	Q99502	592 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.86	■■■□□ 2.69	2e-9	■■■□□ 17.1
SERBP1-208	ENST00000493607	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SERBP1-208	ENST00000493607	LY75	O60449	1722 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	SPG7	Q9UQ90	795 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP27B1	O15528	508 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SERBP1-208	ENST00000493607	ITGB4	P16144	1822 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SERBP1-208	ENST00000493607	KDR	P35968	1356 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	IL13	P35225	146 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	PHKG2	P15735	406 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	MTHFS	P49914	203 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
SERBP1-208	ENST00000493607	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	C5	P01031	1676 aa		31.57	■■■□□ 2.65
SERBP1-208	ENST00000493607	PALLD	Q8WX93	1383 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	PIGB	Q92521	554 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	DCAF5	Q96JK2	942 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SERBP1-208	ENST00000493607	PTGER2	P43116	358 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	KCNQ4	P56696	695 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SERBP1-208	ENST00000493607	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	SIK1	P57059	783 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	HMOX1	P09601	288 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	CFAP53	Q96M91	514 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SERBP1-208	ENST00000493607	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.37	■■■□□ 2.61

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