RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 POLKQ9UBT6 870 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 LRP5O75197 1615 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 BTAF1O14981 1849 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 PROM2Q8N271 834 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 NSD2O96028 1365 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 TXNRD1Q16881 649 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 MORC1Q86VD1 984 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 EYA1Q99502 592 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 NCAPD2Q15021 1401 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 STK32BQ9NY57 414 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP27B1O15528 508 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC15A2Q16348 729 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-211ENST00000493436 CASZ1Q86V15 1759 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 SPG7Q9UQ90 795 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 PAPPAQ13219 1627 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 SPON1Q9HCB6 807 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 LY75O60449 1722 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 ITGB4P16144 1822 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNQ4P56696 695 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF827Q17R98 1081 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBTB7AO95365 584 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PHKG2P15735 406 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MTHFSP49914 203 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 IL13P35225 146 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 AKT1S1Q96B36 256 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PIGBQ92521 554 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PALLDQ8WX93 1383 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 MTFR1LQ9H019 292 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 C5P01031 1676 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PTGER2P43116 358 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 KDRP35968 1356 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-211ENST00000493436 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 DCAF5Q96JK2 942 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 HMOX1P09601 288 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 SIK1P57059 783 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 C4BP0C0L5 1744 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 ATG3Q9NT62 314 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-211ENST00000493436 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 MSH5O43196 834 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 CABP4P57796 275 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 AK7Q96M32 723 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 ARXQ96QS3 562 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.54■■□□□ 1.2
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