RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490240.5

MDK-210, Transcript of midkine, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MDK, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-210ENST00000490240 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.22■■□□□ 1.79
MDK-210ENST00000490240 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
MDK-210ENST00000490240 LY75O60449 1722 aa26.22■■□□□ 1.79
MDK-210ENST00000490240 KCNQ4P56696 695 aa26.21■■□□□ 1.79
MDK-210ENST00000490240 NSD2O96028 1365 aa26.19■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.18■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.18■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 HOXC9P31274 260 aa26.17■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 COG3Q96JB2 828 aa26.17■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 AMPHP49418 695 aa26.16■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.16■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 MEGF6O75095 1541 aa26.14■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 GRIN3BO60391 1043 aa26.14■■□□□ 1.78
MDK-210ENST00000490240 USP47Q96K76 1375 aa26.13■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 MSH5O43196 834 aa26.13■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.12■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 RTL1A6NKG5 1358 aa26.11■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.778e-14■□□□□ 8.6
MDK-210ENST00000490240 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.1■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 FBLN1P23142 703 aa26.09■■□□□ 1.77
MDK-210ENST00000490240 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 MSL1Q68DK7 614 aa26.06■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.06■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 TESK2Q96S53 571 aa26.06■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 TONSLQ96HA7 1378 aa26.06■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 CEP350Q5VT06 3117 aa26.05■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 SLC24A1O60721 1099 aa26.05■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.05■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 NBPF4Q96M43 638 aa26.05■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 C5P01031 1676 aa26.04■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.03■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.03■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.02■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.02■■□□□ 1.76
MDK-210ENST00000490240 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 ATP10DQ9P241 1426 aa26.01■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 PALLDQ8WX93 1383 aa25.99■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.98■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 FYB1O15117 783 aa25.98■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.98■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 IFFO2Q5TF58 517 aa25.97■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 INSRP06213 1382 aa25.96■■□□□ 1.75
MDK-210ENST00000490240 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.94■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 FLT4P35916 1363 aa25.94■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.93■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 AK7Q96M32 723 aa25.93■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 C4BP0C0L5 1744 aa25.93■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.93■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 CYP27B1O15528 508 aa25.92■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 ADCY9O60503 1353 aa25.92■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.91■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.9■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 ITGB4P16144 1822 aa25.9■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 TMF1P82094 1093 aa25.89■■□□□ 1.74
MDK-210ENST00000490240 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.88■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.88■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.87■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.87■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 PHF14O94880 888 aa25.86■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.86■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 PIGBQ92521 554 aa25.85■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 HSPA6P17066 643 aa25.84■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 SSFA2P28290 1259 aa25.84■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
MDK-210ENST00000490240 NCAPD2Q15021 1401 aa25.82■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.81■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 SIK1P57059 783 aa25.81■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 CDCA8Q53HL2 280 aa25.81■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 SMIM5Q71RC9 77 aa25.81■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 SPG7Q9UQ90 795 aa25.81■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.8■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.8■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.79■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.77■■□□□ 1.72
MDK-210ENST00000490240 GNPATO15228 680 aa25.76■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.74■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.74■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.74■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 ATP6V1AP38606 617 aa25.73■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 ITPK1Q13572 414 aa25.73■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.72■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 KIF3CO14782 793 aa25.72■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 MMP10P09238 476 aa25.71■■□□□ 1.71
MDK-210ENST00000490240 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.71■■□□□ 1.71
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