RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.25■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.24■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 HMOX1P09601 288 aa24.23■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 SPG7Q9UQ90 795 aa24.22■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
C7orf49-210ENST00000486115 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
C7orf49-210ENST00000486115 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.2■■□□□ 1.46
C7orf49-210ENST00000486115 FCHSD2O94868 740 aa24.19■■□□□ 1.46
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C7orf49-210ENST00000486115 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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C7orf49-210ENST00000486115 MRS2Q9HD23 443 aa24.19■■□□□ 1.46
C7orf49-210ENST00000486115 ILDR2Q71H61 639 aa24.18■■□□□ 1.46
C7orf49-210ENST00000486115 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.17■■□□□ 1.46
C7orf49-210ENST00000486115 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.17■■□□□ 1.46
C7orf49-210ENST00000486115 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.17■■□□□ 1.46
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C7orf49-210ENST00000486115 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.14■■□□□ 1.45
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C7orf49-210ENST00000486115 CCER2I3L3R5 266 aa24.12■■□□□ 1.45
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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C7orf49-210ENST00000486115 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.11■■□□□ 1.45
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C7orf49-210ENST00000486115 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.07■■□□□ 1.44
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C7orf49-210ENST00000486115 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.05■■□□□ 1.44
C7orf49-210ENST00000486115 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
C7orf49-210ENST00000486115 RUNDC1Q96C34 613 aa24.04■■□□□ 1.44
C7orf49-210ENST00000486115 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.04■■□□□ 1.44
C7orf49-210ENST00000486115 DCAF5Q96JK2 942 aa24.03■■□□□ 1.44
C7orf49-210ENST00000486115 MAP3K5Q99683 1374 aa24.02■■□□□ 1.44
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C7orf49-210ENST00000486115 NFE2L2Q16236 605 aa23.99■■□□□ 1.43
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C7orf49-210ENST00000486115 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
C7orf49-210ENST00000486115 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
C7orf49-210ENST00000486115 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.96■■□□□ 1.43
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C7orf49-210ENST00000486115 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
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C7orf49-210ENST00000486115 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.94■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 KCNQ2O43526 872 aa23.93■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 SBF2Q86WG5 1849 aa23.93■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.93■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 CABP4P57796 275 aa23.92■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 RIPK4P57078 832 aa23.91■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.9■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 MRC1P22897 1456 aa23.9■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 SOCS7O14512 581 aa23.9■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 APBA3O96018 575 aa23.9■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 BAG6P46379 1132 aa23.9■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
C7orf49-210ENST00000486115 APAF1O14727 1248 aa23.89■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 TEFQ10587 303 aa23.89■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 LGR6Q9HBX8 967 aa23.89■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.89■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.88■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 EP400Q96L91 3159 aa23.88■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.88■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 NEUROD2Q15784 382 aa23.87■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 IL17REQ8NFR9 667 aa23.87■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 PIGBQ92521 554 aa23.87■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 MCM10Q7L590 875 aa23.86■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.86■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 BTAF1O14981 1849 aa23.84■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 PLSCR1O15162 318 aa23.84■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.84■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 ITGB4P16144 1822 aa23.84■■□□□ 1.41
C7orf49-210ENST00000486115 DCTN1Q14203 1278 aa23.83■■□□□ 1.41
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