RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 TNS2Q63HR2 1409 aa12.02□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.01□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 CARD11Q9BXL7 1154 aa12.01□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 IP6K1Q92551 441 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 MYOM1P52179 1685 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP12Q02952 1782 aa11.98□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.97□□□□□ -0.49
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CTPS1-208ENST00000479480 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.97□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PP64 1363 aa11.96□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 GPR162Q16538 588 aa11.96□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL34Q8N239 644 aa11.96□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CTPS1-208ENST00000479480 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 UTRNP46939 3433 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 HOXC9P31274 260 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 C1QTNF8P60827 252 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 TESK2Q96S53 571 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC6O95255 1503 aa11.95□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K5Q99683 1374 aa11.94□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 NHSQ6T4R5 1651 aa11.94□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.94□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF4Q96M43 638 aa11.94□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 PAPPAQ13219 1627 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 AMPHP49418 695 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 MIER1Q8N108 512 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 SPOCK2Q92563 424 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 COG3Q96JB2 828 aa11.93□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 NSD2O96028 1365 aa11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 POLD1P28340 1107 aa11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.91□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 BTAF1O14981 1849 aa11.9□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 FYB1O15117 783 aa11.9□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.58e-7■□□□□ 8.9
CTPS1-208ENST00000479480 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.9□□□□□ -0.5
CTPS1-208ENST00000479480 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
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CTPS1-208ENST00000479480 USP54Q70EL1 1684 aa11.89□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 MEGF6O75095 1541 aa11.88□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.88□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM5Q71RC9 77 aa11.88□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 LTN1O94822 1766 aa11.87□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 TONSLQ96HA7 1378 aa11.87□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.86□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 USP47Q96K76 1375 aa11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 CYP27B1O15528 508 aa11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.85□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 PITPNM1O00562 1244 aa11.84□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 GRIN3BO60391 1043 aa11.84□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 CREBZFQ9NS37 354 aa11.84□□□□□ -0.51
CTPS1-208ENST00000479480 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.83□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.83□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PIGBQ92521 554 aa11.82□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.82□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.82□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 INSRP06213 1382 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 SLC24A1O60721 1099 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 TMF1P82094 1093 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.81□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 RTL1A6NKG5 1358 aa11.8□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PALLDQ8WX93 1383 aa11.8□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 CHD4Q14839 1912 aa11.8□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.8□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.8□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 PHF14O94880 888 aa11.79□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.79□□□□□ -0.52
CTPS1-208ENST00000479480 LY75O60449 1722 aa11.79□□□□□ -0.52
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