RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 AMPHP49418 695 aa18.44■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 UTRNP46939 3433 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 HOXC9P31274 260 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 TONSLQ96HA7 1378 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 GRIN3BO60391 1043 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 KLHL34Q8N239 644 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 USP47Q96K76 1375 aa18.41■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 NSD2O96028 1365 aa18.4■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.4■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
TNS3-211ENST00000474346 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.39■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 TESK2Q96S53 571 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 MEGF6O75095 1541 aa18.37■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 MSH5O43196 834 aa18.36■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.36■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.36■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 KCNQ4P56696 695 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 NBPF4Q96M43 638 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS3-211ENST00000474346 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.33■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 C5P01031 1676 aa18.33■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 INSRP06213 1382 aa18.32■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.32■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 FYB1O15117 783 aa18.31■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 FLT4P35916 1363 aa18.3■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 TMF1P82094 1093 aa18.3■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 CDCA8Q53HL2 280 aa18.3■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 PALLDQ8WX93 1383 aa18.3■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 FBLN1P23142 703 aa18.29■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.28■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.28■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.27■□□□□ 0.52
TNS3-211ENST00000474346 MSL1Q68DK7 614 aa18.26■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.26■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.25■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 AK7Q96M32 723 aa18.25■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 C4BP0C0L5 1744 aa18.25■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 ATP10DQ9P241 1426 aa18.24■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.24■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.24■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 CYP27B1O15528 508 aa18.23■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 SPG7Q9UQ90 795 aa18.23■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 ITGB4P16144 1822 aa18.23■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 SSFA2P28290 1259 aa18.22■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 ADCY9O60503 1353 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 IFFO2Q5TF58 517 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 NCAPD2Q15021 1401 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS3-211ENST00000474346 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.2■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.2■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.19■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 PIGBQ92521 554 aa18.18■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 SIK1P57059 783 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.16■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 PHF14O94880 888 aa18.15■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 HSPA6P17066 643 aa18.15■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.15■□□□□ 0.5
TNS3-211ENST00000474346 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.14■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 ATP6V1AP38606 617 aa18.12■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.12■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 CEP350Q5VT06 3117 aa18.12■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 GNPATO15228 680 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 PHKG2P15735 406 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 EYA1Q99502 592 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 ZNF831Q5JPB2 1677 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 TGFB2P61812 414 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 ADRA2BP18089 450 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms