RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473661.5

TTLL3-225, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 5

Gene TTLL3, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-225	ENST00000473661	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	MYT1	Q01538	1121 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	TEF	Q10587	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	IL2RB	P14784	551 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	ABCC6	O95255	1503 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TTLL3-225	ENST00000473661	HSPA1L	P34931	641 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	C8orf37	Q96NL8	207 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25	2e-6	■□□□□ 8.8
TTLL3-225	ENST00000473661	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	CRB1	P82279	1406 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661		A0A0G2JS52	829 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	CHL1	O00533	1208 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	PLIN1	O60240	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	PHKG2	P15735	406 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	EXOC5	O00471	708 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	BCAR3	O75815	825 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-225	ENST00000473661	COL18A1	P39060	1754 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	CABP4	P57796	275 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	MEGF6	O75095	1541 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	MS4A1	P11836	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	USP21	Q9UK80	565 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	CYP27B1	O15528	508 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	ABCA3	Q99758	1704 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	VAMP4	O75379	141 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	DDB1	Q16531	1140 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-225	ENST00000473661	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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