RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466995.5

TIMM17B-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM17B, Length 1,528 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-205ENST00000466995 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.29■□□□□ 0.84
TIMM17B-205ENST00000466995 LRRC37A3O60309 1634 aa20.28■□□□□ 0.84
TIMM17B-205ENST00000466995 KDRP35968 1356 aa20.28■□□□□ 0.84
TIMM17B-205ENST00000466995 TNS2Q63HR2 1409 aa20.27■□□□□ 0.84
TIMM17B-205ENST00000466995 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.27■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 MIER1Q8N108 512 aa20.27■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 PRKAR2BP31323 418 aa20.25■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 SPG7Q9UQ90 795 aa20.25■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 NEFMP07197 916 aa20.24■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.24■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.23■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.23■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 FCHSD2O94868 740 aa20.22■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 FAM182BQ5T319 152 aa20.22■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.22■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.22■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.21■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.21■□□□□ 0.83
TIMM17B-205ENST00000466995 CCER2I3L3R5 266 aa20.2■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 ILDR2Q71H61 639 aa20.2■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.2■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.19■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.19■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.19■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.18■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 CYP27B1O15528 508 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM17B-205ENST00000466995 PHKG2P15735 406 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 RUNDC1Q96C34 613 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.12■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.12■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 MAP3K5Q99683 1374 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 NEUROD2Q15784 382 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 NFE2L2Q16236 605 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 TRIM37O94972 964 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 DCAF5Q96JK2 942 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 EP400Q96L91 3159 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM17B-205ENST00000466995 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 BCL9O00512 1426 aa20.06■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 APAF1O14727 1248 aa20.06■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 RIPK4P57078 832 aa20.06■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 KCNQ2O43526 872 aa20.05■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 CABP4P57796 275 aa20.03■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 MCM10Q7L590 875 aa20.03■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 LGR6Q9HBX8 967 aa20.03■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.03■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.03■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.02■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 NHSQ6T4R5 1651 aa20.02■□□□□ 0.8
TIMM17B-205ENST00000466995 DCTN1Q14203 1278 aa20.02■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.02■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.01■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.01■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 TEFQ10587 303 aa20.01■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 SBF2Q86WG5 1849 aa20■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 APBA3O96018 575 aa19.99■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 IL17REQ8NFR9 667 aa19.99■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.99■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.98■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.98■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.98■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 PIGBQ92521 554 aa19.97■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 CCDC125Q86Z20 511 aa19.97■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.96■□□□□ 0.79
TIMM17B-205ENST00000466995 MRC1P22897 1456 aa19.95■□□□□ 0.78
TIMM17B-205ENST00000466995 BTAF1O14981 1849 aa19.95■□□□□ 0.78
TIMM17B-205ENST00000466995 ITGB4P16144 1822 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms