RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466662.1

PNCK-223, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 464 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-223	ENST00000466662	BTAF1	O14981	1849 aa		24.59	■■□□□ 1.53
PNCK-223	ENST00000466662	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
PNCK-223	ENST00000466662	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		24.58	■■□□□ 1.53
PNCK-223	ENST00000466662	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		24.57	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		24.56	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	PLSCR1	O15162	318 aa		24.54	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	24.53	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	EYA1	Q99502	592 aa		24.53	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	24.52	■■□□□ 1.52
PNCK-223	ENST00000466662	KCNQ2	O43526	872 aa		24.51	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		24.5	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		24.49	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		24.49	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		24.49	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		24.48	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		24.48	■■□□□ 1.51
PNCK-223	ENST00000466662	ITGB4	P16144	1822 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	LY75	O60449	1722 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	LRP5	O75197	1615 aa		24.45	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	PAPPA	Q13219	1627 aa		24.43	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	CYP27B1	O15528	508 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	MTHFS	P49914	203 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	PROM2	Q8N271	834 aa		24.42	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	24.42	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	IL13	P35225	146 aa		24.4	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	TXNRD1	Q16881	649 aa		24.4	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	SPG7	Q9UQ90	795 aa		24.4	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		24.4	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	KDR	P35968	1356 aa		24.4	■■□□□ 1.5
PNCK-223	ENST00000466662	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	NBPF14	Q5TI25	921 aa		24.39	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	24.37	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	CASZ1	Q86V15	1759 aa		24.37	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	24.35	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		24.35	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	PHKG2	P15735	406 aa		24.33	■■□□□ 1.49
PNCK-223	ENST00000466662	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		24.32	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	24.3	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		24.3	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	C5	P01031	1676 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		24.29	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	24.28	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		24.28	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	24.27	■■□□□ 1.48
PNCK-223	ENST00000466662	STK32B	Q9NY57	414 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	24.26	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	PPP2R1A	P30153	589 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	SLC15A2	Q16348	729 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	24.25	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	PALLD	Q8WX93	1383 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	24.23	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	HMOX1	P09601	288 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	PIGB	Q92521	554 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	DCAF5	Q96JK2	942 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	CFAP53	Q96M91	514 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF827	Q17R98	1081 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	24.21	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PNCK-223	ENST00000466662	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	24.2	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	KCNQ4	P56696	695 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	AKT1S1	Q96B36	256 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	C4B	P0C0L5	1744 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	MRC1	P22897	1456 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PNCK-223	ENST00000466662	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	SPON1	Q9HCB6	807 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	NUDC	Q9Y266	331 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	ATG3	Q9NT62	314 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	SIK1	P57059	783 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PNCK-223	ENST00000466662	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		24.1	■■□□□ 1.45

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