RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.12■□□□□ 0.49
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 NBPF4Q96M43 638 aa18.12■□□□□ 0.49
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDCA8Q53HL2 280 aa18.11■□□□□ 0.49
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 NSD2O96028 1365 aa18.08■□□□□ 0.49
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 AKT1S1Q96B36 256 aa18.08■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SYT17Q9BSW7 474 aa18.08■□□□□ 0.48
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-217ENST00000452612 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.04■□□□□ 0.48
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CHD4Q14839 1912 aa18.04■□□□□ 0.48
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ITGB4P16144 1822 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KLHL34Q8N239 644 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.02■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-217ENST00000452612 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.01■□□□□ 0.47
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.01■□□□□ 0.47
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLC16A10Q8TF71 515 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18■□□□□ 0.47
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 EYA1Q99502 592 aa17.93■□□□□ 0.46
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPG7Q9UQ90 795 aa17.91■□□□□ 0.46
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 UBR3Q6ZT12 1888 aa17.9■□□□□ 0.46
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMIM5Q71RC9 77 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AK7Q96M32 723 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PHKG2P15735 406 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AMIGO3Q86WK7 504 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
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TTC28-AS1-217ENST00000452612 PHF14O94880 888 aa17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SIK1P57059 783 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ASAP1Q9ULH1 1129 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LINC00116Q8NCU8 138 aa17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IGSF1Q8N6C5 1336 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ATP6V1AP38606 617 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ITPK1Q13572 414 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MORC1Q86VD1 984 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ATG3Q9NT62 314 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GNPATO15228 680 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SSFA2P28290 1259 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.78■□□□□ 0.44
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