RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449692.3

C11orf68-202, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C11orf68, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-202ENST00000449692 SOCS7O14512 581 aa40.56■■■■■ 4.08
C11orf68-202ENST00000449692 FAM182BQ5T319 152 aa40.56■■■■■ 4.08
C11orf68-202ENST00000449692 NUDCQ9Y266 331 aa40.56■■■■■ 4.08
C11orf68-202ENST00000449692 HMOX1P09601 288 aa40.54■■■■■ 4.08
C11orf68-202ENST00000449692 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
C11orf68-202ENST00000449692 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
C11orf68-202ENST00000449692 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.5■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 PKD1L3Q7Z443 1732 aa40.47■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP40.47■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa40.47■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.07
C11orf68-202ENST00000449692 FAM196AQ6ZSG2 479 aa40.43■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 SPG7Q9UQ90 795 aa40.43■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa40.41■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa40.41■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC184Q52MB2 194 aa40.4■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 RSPH6AQ9H0K4 717 aa40.4■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 CYP27B1O15528 508 aa40.4■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
C11orf68-202ENST00000449692 BCL9O00512 1426 aa40.38■■■■■ 4.05
C11orf68-202ENST00000449692 FCHSD2O94868 740 aa40.37■■■■■ 4.05
C11orf68-202ENST00000449692 AMOTQ4VCS5 1084 aa40.37■■■■■ 4.05
C11orf68-202ENST00000449692 PRKAR2BP31323 418 aa40.35■■■■■ 4.05
C11orf68-202ENST00000449692 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.05
C11orf68-202ENST00000449692 SBF2Q86WG5 1849 aa40.3■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 PHKG2P15735 406 aa40.3■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 IFNL2Q8IZJ0 200 aa40.3■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 PHACTR3Q96KR7 559 aa40.29■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 MRS2Q9HD23 443 aa40.27■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 TRIM37O94972 964 aa40.27■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 KAT6BQ8WYB5 2073 aa40.26■■■■■ 4.04
C11orf68-202ENST00000449692 PLEKHF1Q96S99 279 aa40.24■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.24■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 ACSBG1Q96GR2 724 aa40.23■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 PTF1AQ7RTS3 328 aa40.22■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 KCNQ2O43526 872 aa40.21■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 C1orf141Q5JVX7 400 aa40.21■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC125Q86Z20 511 aa40.21■■■■■ 4.03
C11orf68-202ENST00000449692 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.19■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 AKAP4Q5JQC9 854 aa40.18■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 GAS2L2Q8NHY3 880 aa40.18■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 NHSQ6T4R5 1651 aa40.18■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa40.16■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 DCAF5Q96JK2 942 aa40.14■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
C11orf68-202ENST00000449692 NEFMP07197 916 aa40.12■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa40.12■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC146Q8IYE0 955 aa40.1■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 MIER1Q8N108 512 aa40.1■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa40.09■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 MAP3K5Q99683 1374 aa40.08■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 APBA3O96018 575 aa40.08■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 ITGB4P16144 1822 aa40.08■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 GNAT3A8MTJ3 354 aa40.07■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 CCER2I3L3R5 266 aa40.07■■■■■ 4.01
C11orf68-202ENST00000449692 RUNDC1Q96C34 613 aa40.06■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 LGR6Q9HBX8 967 aa40.06■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 SCN11AQ9UI33 1791 aa40.06■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 BTAF1O14981 1849 aa40.05■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 ERVV-2B6SEH9 535 aa40.05■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 DEFB132Q7Z7B7 95 aa40.05■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 RNMTO43148 476 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa40.03■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 NFE2L2Q16236 605 aa40.03■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 BAG6P46379 1132 aa40.02■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
C11orf68-202ENST00000449692 IL17REQ8NFR9 667 aa40.01■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 PIGBQ92521 554 aa40.01■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 DLG5Q8TDM6 1919 aa40■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 TMOD3Q9NYL9 352 aa39.99■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 PLSCR1O15162 318 aa39.97■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 TMPOP42166 694 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 CABP4P57796 275 aa39.97■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 FAM9BQ8IZU0 186 aa39.96■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa39.95■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 CAMKK2Q96RR4 588 aa39.95■■■■□ 3.99
C11orf68-202ENST00000449692 MRC1P22897 1456 aa39.94■■■■□ 3.98
C11orf68-202ENST00000449692 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa39.93■■■■□ 3.98
C11orf68-202ENST00000449692 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
C11orf68-202ENST00000449692 SLC52A2Q9HAB3 445 aa39.93■■■■□ 3.98
C11orf68-202ENST00000449692 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
C11orf68-202ENST00000449692 RIPK4P57078 832 aa39.92■■■■□ 3.98
C11orf68-202ENST00000449692 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms