RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.84□□□□□ -0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 RALBP1Q15311 655 aa14.84□□□□□ -0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.84□□□□□ -0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC184Q52MB2 194 aa14.83□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.81□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP27B1O15528 508 aa14.81□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM37O94972 964 aa14.81□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.81□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 SBF2Q86WG5 1849 aa14.8□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNQ2O43526 872 aa14.8□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 CFAP53Q96M91 514 aa14.8□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 KDRP35968 1356 aa14.8□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.79□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.78□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.78□□□□□ -0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.77□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.77□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.76□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.76□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.75□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PRKAR2BP31323 418 aa14.75□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 SPG7Q9UQ90 795 aa14.75□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ANP32CO43423 234 aa14.74□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PHKG2P15735 406 aa14.74□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 NUDCQ9Y266 331 aa14.73□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 NHSQ6T4R5 1651 aa14.73□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 APBA3O96018 575 aa14.72□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 15.4
RPRD1B-202ENST00000449186 BCL9O00512 1426 aa14.72□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 BTAF1O14981 1849 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ITGB4P16144 1822 aa14.71□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 LGR6Q9HBX8 967 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 FCHSD2O94868 740 aa14.68□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNQ4P56696 695 aa14.68□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC125Q86Z20 511 aa14.68□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.68□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.67□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 PROM2Q8N271 834 aa14.67□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 PIGBQ92521 554 aa14.67□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 MRS2Q9HD23 443 aa14.67□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.66□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 BAG6P46379 1132 aa14.66□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.65□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 DCTN1Q14203 1278 aa14.65□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.65□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 IL17REQ8NFR9 667 aa14.65□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.64□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 DCAF5Q96JK2 942 aa14.64□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.64□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP3K5Q99683 1374 aa14.63□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.63□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 MCM10Q7L590 875 aa14.63□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 MIER1Q8N108 512 aa14.63□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.63□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.63□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 RREB1Q92766 1687 aa14.62□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 CABP4P57796 275 aa14.62□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.62□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.62□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.62□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.61□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.61□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PLSCR1O15162 318 aa14.61□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 NFE2L2Q16236 605 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms