RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439466.3

CT47A5-201, Transcript of cancer/testis antigen family 47, member A5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CT47A5, Length 1,298 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A5-201ENST00000439466 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.84■■□□□ 1.57
CT47A5-201ENST00000439466 MEGF6O75095 1541 aa24.83■■□□□ 1.57
CT47A5-201ENST00000439466 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.83■■□□□ 1.57
CT47A5-201ENST00000439466 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.83■■□□□ 1.57
CT47A5-201ENST00000439466 BCL9O00512 1426 aa24.82■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 LRRC37A3O60309 1634 aa24.81■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 FCHSD2O94868 740 aa24.8■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.8■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.8■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 CCDC125Q86Z20 511 aa24.79■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.79■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.79■■□□□ 1.56
CT47A5-201ENST00000439466 HMOX1P09601 288 aa24.76■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.73■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.73■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 NEFMP07197 916 aa24.72■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 CYP27B1O15528 508 aa24.71■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.71■■□□□ 1.55
CT47A5-201ENST00000439466 FAM182BQ5T319 152 aa24.7■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 PHKG2P15735 406 aa24.69■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 PRKAR2BP31323 418 aa24.69■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.69■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.69■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.66■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 DCAF5Q96JK2 942 aa24.66■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 MRS2Q9HD23 443 aa24.66■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CT47A5-201ENST00000439466 TRIM37O94972 964 aa24.63■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.63■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.63■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 EP400Q96L91 3159 aa24.62■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 CCER2I3L3R5 266 aa24.62■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.62■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.61■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.61■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.61■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.58■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 BAG6P46379 1132 aa24.58■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 CCDC184Q52MB2 194 aa24.58■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 RUNDC1Q96C34 613 aa24.58■■□□□ 1.53
CT47A5-201ENST00000439466 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.57■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 MAP3K5Q99683 1374 aa24.56■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 PLSCR1O15162 318 aa24.56■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 APBA3O96018 575 aa24.56■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 KCNQ2O43526 872 aa24.55■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 NFE2L2Q16236 605 aa24.55■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 SBF2Q86WG5 1849 aa24.54■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 NHSQ6T4R5 1651 aa24.54■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.54■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.54■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 CABP4P57796 275 aa24.52■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CT47A5-201ENST00000439466 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.5■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.49■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.49■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 PIGBQ92521 554 aa24.49■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 IL17REQ8NFR9 667 aa24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 LGR6Q9HBX8 967 aa24.48■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.47■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.46■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 RIPK4P57078 832 aa24.46■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 TEFQ10587 303 aa24.46■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 MIER1Q8N108 512 aa24.46■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.46■■□□□ 1.51
CT47A5-201ENST00000439466 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CT47A5-201ENST00000439466 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.45■■□□□ 1.5
CT47A5-201ENST00000439466 MRC1P22897 1456 aa24.45■■□□□ 1.5
CT47A5-201ENST00000439466 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.44■■□□□ 1.5
CT47A5-201ENST00000439466 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.44■■□□□ 1.5
CT47A5-201ENST00000439466 NGEFQ8N5V2 710 aa24.43■■□□□ 1.5
CT47A5-201ENST00000439466 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms