RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-215ENST00000438141 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.76■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 GCP02774 474 aa16.75■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 MSH6P52701 1360 aa16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 KIAA0232Q92628 1395 aa16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.73■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.73■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.73■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.72■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 PXDNQ92626 1479 aa16.71■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.71■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.71■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 NBPF4Q96M43 638 aa16.71■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.71■□□□□ 0.27
TTLL3-215ENST00000438141 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 MAP3K5Q99683 1374 aa16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 RGPD5Q99666 1765 aa16.69■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 KRT24Q2M2I5 525 aa16.69■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 ABCC4O15439 1325 aa16.69■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.69■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 PDE4AP27815 886 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 BACH2Q9BYV9 841 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 COL18A1P39060 1754 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 ABCC6O95255 1503 aa16.66■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 IL17REQ8NFR9 667 aa16.66■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 RGS12O14924 1447 aa16.66■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.65■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.65■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.65■□□□□ 0.26
TTLL3-215ENST00000438141 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 BRINP3Q76B58 766 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 ERBB3P21860 1342 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 RGS3P49796 1198 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 CACNA1FO60840 1977 aa16.6■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 PLEKHG5O94827 1062 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 MSH5O43196 834 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 CPDO75976 1380 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 PTPRCP08575 1304 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 C8orf34Q49A92 452 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL3-215ENST00000438141 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SMC5Q8IY18 1101 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 FAM161AQ3B820 660 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 ABCA3Q99758 1704 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 LGR6Q9HBX8 967 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SLAIN2Q9P270 581 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.55■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SLC4A2P04920 1241 aa16.55■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 G2E3Q7L622 706 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 MEGF6O75095 1541 aa16.52■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.52■□□□□ 0.24
TTLL3-215ENST00000438141 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL3-215ENST00000438141 ATP10DQ9P241 1426 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms