RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.57□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.56□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RUNDC1Q96C34 613 aa13.56□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NBPF4Q96M43 638 aa13.56□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP21Q9UK80 565 aa13.56□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NRAPQ86VF7 1730 aa13.56□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.53□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.53□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.5□□□□□ -0.25
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RIPK4P57078 832 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.46□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.45□□□□□ -0.26
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAP3K5Q99683 1374 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EXOC5O00471 708 aa13.44□□□□□ -0.26
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DISP2A7MBM2 1401 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNS2Q63HR2 1409 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GNAT3A8MTJ3 354 aa13.43□□□□□ -0.26
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.43□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFNL2Q8IZJ0 200 aa13.43□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC27Q2M243 656 aa13.42□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ILDR2Q71H61 639 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLI3P10071 1580 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC37A3O60309 1634 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDE3BQ13370 1112 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHKG2P15735 406 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RXRBP28702 533 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WWC1Q8IX03 1113 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DCAF5Q96JK2 942 aa13.39□□□□□ -0.27
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