RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT57Q9NWB7 429 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 NME9Q86XW9 330 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF853P0CG23 659 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC45O75419 566 aa22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM83GA6ND36 823 aa22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 IL13P35225 146 aa22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 AK9Q5TCS8 1911 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TBX22Q9Y458 520 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP44Q96MT7 982 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OFD1O75665 1012 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DCTN1Q14203 1278 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF445P59923 1031 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DCTPP1Q9H773 170 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC22Q5TAA0 569 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ACEP12821 1306 aa22.56■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP12Q02952 1782 aa22.56■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.56■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MCTP1Q6DN14 999 aa22.56■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNA6P17658 529 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TERF1P54274 439 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 RABEP1Q15276 862 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT24Q2M2I5 525 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ITSN1Q15811 1721 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NUCB2P80303 420 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 HS1BP3Q53T59 392 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 COG3Q96JB2 828 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 USP26Q9BXU7 913 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 APBB1O00213 710 aa22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP10DQ9P241 1426 aa22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.52■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PKP1Q13835 747 aa22.52■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.52■■□□□ 1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RBSNQ9H1K0 784 aa22.52■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 DIP2AQ14689 1571 aa22.5■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SDSP20132 328 aa22.5■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS12O14924 1447 aa22.5■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.49■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.49■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP85Q6P2H3 762 aa22.49■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MSH6P52701 1360 aa22.48■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 USP6P35125 1406 aa22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MEIS3Q99687 375 aa22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM10Q7L590 875 aa22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms