RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 CFAP53Q96M91 514 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 NHSQ6T4R5 1651 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 BCL9O00512 1426 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD12-202ENST00000406506 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 BTAF1O14981 1849 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 HMOX1P09601 288 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC125Q86Z20 511 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 SPG7Q9UQ90 795 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 ITGB4P16144 1822 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 CYP27B1O15528 508 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 TRIM37O94972 964 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 NUDCQ9Y266 331 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD12-202ENST00000406506 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 RREB1Q92766 1687 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 ANP32CO43423 234 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 PHKG2P15735 406 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 KCNQ2O43526 872 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 BAG6P46379 1132 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 PRKAR2BP31323 418 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 APBA3O96018 575 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 FCHSD2O94868 740 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 LY75O60449 1722 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
HOXD12-202ENST00000406506 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 DCAF5Q96JK2 942 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 MRC1P22897 1456 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 MAP3K5Q99683 1374 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 PLSCR1O15162 318 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC184Q52MB2 194 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-202ENST00000406506 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 PAPPAQ13219 1627 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 NEFMP07197 916 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 PIGBQ92521 554 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 MRS2Q9HD23 443 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 C5P01031 1676 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 LGR6Q9HBX8 967 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD12-202ENST00000406506 PALLDQ8WX93 1383 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 TXNRD1Q16881 649 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 PROM2Q8N271 834 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 CABP4P57796 275 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 NFE2L2Q16236 605 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.54■■□□□ 1.68
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