RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 PSMA5P28066 241 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ESPNB1AK53 854 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF592Q92610 1267 aa22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.02■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 FOXO3O43524 673 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 ANXA1P04083 346 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 ABCC2Q92887 1545 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 ANKLE2Q86XL3 938 aa22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 ARHGAP45Q92619 1136 aa22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 TSPY26PQ9H489 355 aa22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 TRDNQ13061 729 aa22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 TATP17735 454 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 MAGI2Q86UL8 1455 aa22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 KDM4AO75164 1064 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 SMC5Q8IY18 1101 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 SYCE3A1L190 88 aa21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 SDSP20132 328 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 TTC22Q5TAA0 569 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 PTPRCP08575 1304 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NOMO3-202ENST00000399336 FAM177BA6PVY3 158 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PDCP20941 246 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 FERMT3Q86UX7 667 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 STRN4Q9NRL3 753 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PTPRTO14522 1441 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 HIP1O00291 1037 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 SDF4Q9BRK5 362 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CABP4P57796 275 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 KDM5CP41229 1560 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 SPC24Q8NBT2 197 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 SPG7Q9UQ90 795 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PANK2Q9BZ23 570 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM29Q14134 588 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM5Q9C035 493 aa21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NOMO3-202ENST00000399336 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.89■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.89■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.89■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PLA2R1Q13018 1463 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PDE1AP54750 535 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 KRT85P78386 507 aa21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 RAB11FIP3O75154 756 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms